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苹果属栽培种楸子的遗传多样性与遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 高源 1 ; 王昆 1 ; 王大江 1 ; 张彩霞 1 ; 丛佩华 1 ; 刘立军 1 ; 李连文 1 ; 朴继成 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院果树研究所/农业部园艺作物种质资源利用重点实验室

关键词: 苹果属;楸子;荧光SSR;遗传多样性;遗传结构

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 79-89

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用荧光SSR分子标记,对新收集的苹果属栽培种楸子种质资源进行了遗传多样性和群体结构分析,明确群体内和群体间的遗传多样性和结构,为苹果属植物种质资源的收集保存和砧木育种亲本选择提供参考。利用荧光SSR构建研究材料的指纹数据,主要利用GenAlEx 6.501软件分析遗传多样性,利用POPULATION 1.2软件基于Nei遗传距离构建Neighbour-Joining(NJ)树,并利用STRUCTURE 2.3.4软件进行群体结构分析。结果表明:19对SSR引物共检测出390个多态性等位变异,平均多态性等位基因数为20.526,平均有效等位基因数为9.399,观察杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.706和0.868,香农多样性指数为2.446,高于以往研究的苹果属植物的遗传多样性。基于Nei遗传距离的聚类分析,在遗传距离0.9167处155份材料可以分成3个类群,3个类群间的遗传距离较近,并没有完全按来源地划分为相应的类群。群体结构分析将155份材料划分成了2个稳定的群体,群体结构分组与NJ聚类有相似的结果,其中150份材料的Q值均大于0.6,血缘相对单一。

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