文献类型： 中文期刊

作者： 夏博策 ¹ ; 张凯艺 ¹ ; 苗佳坤 ¹ ; 彭焕祺 ¹ ; 杨宇 ¹ ; 陶聪 ¹ ; 吴添文 ¹ ; 王彦芳 ¹ ; 杨述林 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

关键词： 富营养饮食;代谢性脂肪肝病;代谢性疾病易感猪;可变剪接;剪接因子

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 008 期

页码： 2537-2547

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在探讨富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接（alternative splicing, AS）和剪接因子（splicing factors, SFs）的影响。本研究以健康状态、月龄和体重相同的12头代谢性疾病易感公猪为材料，随机将其分为两组，其中8头猪饲喂高脂高能量饲料2个月作为富营养饮食组（TG-HFHSD）,4头猪饲喂正常饲料2个月作为对照饮食组（TG-CD）。对TG-HFHSD和TG-CD的脂肪、肝、肌肉和下丘脑组织进行RNA-seq测序，利用rMATS软件鉴定组间差异AS,对差异剪接基因（differential splicing genes, DSGs）进行GO和KEGG富集分析，并利用DESeq2软件和皮尔逊相关性系数分析肝组织中的SFs。结果显示，脂肪、肝、肌肉和下丘脑中分别鉴定到48 279、 39 536、47 888和52 210个AS事件，均以SE类型为主，占比在77.09%～78.29%之间。脂肪、肝、肌肉和下丘脑中的DSGs数分别为528、1 070、570和600个，其中肝增加的DSGs部分主要是RI和MXE两种类型，分别为177和471个，而其它组织仅为12～28个和99～110个。GO和KEGG富集显示，肝DSGs除富集到细胞结构相关的过程外，还显著富集到可变剪接及mRNA代谢、脂质代谢、DNA损伤及修复、补体与凝血级联等过程。肝中筛选到56个差异表达的SFs,其中CLK1、PGC-1ɑ、USP4等与糖脂代谢和代谢性疾病密切相关。本研究表明，富营养饮食显著增加了肝DSGs,通过剪接调控、糖脂代谢以及DNA损伤来影响肝代谢性疾病的发生，将为肝代谢性疾病早期发生机制研究提供参考。