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多房棘球蚴感染小鼠肝转录组分析及肝纤维化关键基因的筛选与验证

文献类型： 中文期刊

作者： 孙慧 1 ; 李立 1 ; 闫鸿斌 1 ; 李秀荣 1 ; 吴耀东 1 ; 何兴 2 ; 殷宏 1 ; 付宝权 1 ; 贾万忠 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院兰州兽医研究所兰州大学动物医学与生物安全学院动物疫病防控全国重点实验室甘肃省病原生物学基础学科研究中心甘肃省动物寄生虫病重点实验室国家动物包虫病专业实验室

2.中国人民解放军海军军医大学

关键词： 多房棘球蚴;转录组测序;生物信息学;纤维化;神经生长因子

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2024 年 54 卷 009 期

页码： 1157-1168

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究多房棘球蚴感染引起宿主肝纤维化的关键基因变化，通过建立多房棘球蚴感染小鼠模型，利用高通量测序技术获得感染小鼠肝不同时间点差异m RNA表达谱，结合DisGeNET、GeneGards等数据库中已收录的肝纤维化相关基因集，挖掘感染进程中影响肝纤维化的重要基因。结果显示，多房棘球蚴感染小鼠肝出现胶原纤维沉积；通过转录组测序数据结合vlookup函数检索，发现2 943个肝纤维化相关基因在感染后不同时间出现差异表达，其中显著上调的基因主要富集在PI3K-Akt等通路上，实时荧光定量PCR验证结果与高通量测序结果一致，通路中神经生长因子（Ngf）、肌腱蛋白C(Tnc)基因在肝星状细胞中表达量显著高于肝实质细胞、肝窦内皮细胞和枯否细胞，在小鼠原代肝星状细胞中敲低Ngf基因影响胶原基因Col1α1及Timp1的表达，推测这些通路和基因可能参与多房棘球蚴感染后致小鼠肝组织纤维化的过程。

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