文献类型： 中文期刊
作者： 张小伟 1 ; 何军敏 2 ; 徐新明 3 ; 田月珍 3 ; 关鸣轩 1 ; 张漫 1 ; 付雪峰 3 ; 哈尼克孜?吐拉甫 3 ; 黄锡霞 1 ; 田可川 4 ;
作者机构： 1.新疆农业大学动物科学学院
2.新疆畜牧科学院畜牧研究所
3.新疆维吾尔自治区畜牧科学院畜牧研究所
4.山东省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词： miRNA;lncRNA;mRNA;毛囊发育;调控网络;苏博美利奴羊
期刊名称： 中国畜牧杂志
ISSN： 0258-7033
年卷期： 2022 年 58 卷 007 期
页码： 122-133
收录情况： 北大核心
摘要： 为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络.结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接.通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能.通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径.筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因.通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博美利奴羊毛囊发育的分子作用机制进行系统性挖掘.
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