文献类型: 中文期刊
作者: 简子林 1 ; 王自力 1 ; 秦畅 1 ; 陈松树 1 ; 刘晓娟 1 ; 何方 1 ; 任明见 1 ;
作者机构: 1.贵州大学农学院/国家小麦改良中心贵州分中心
关键词: 高粱;磷脂酶C(PLC);基因家族;非生物胁迫;表达分析
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2024 年 52 卷 023 期
页码: 38-48
收录情况: 北大核心
摘要: 磷脂酶C(PLC)是磷酸肌醇代谢中重要的水解酶之一,在调节植物生长发育、应对逆境胁迫和多种信号转导过程中发挥着重要功能。鉴定高粱的PLC基因家族,能够为磷脂酶C基因功能研究提供理论依据,有利于筛选出植物抗逆发育生长的有效基因。基于高粱全基因组数据,鉴定得到高粱PLC基因家族,通过生物信息学方法分析并研究高粱PLC基因家族成员的理化性质、染色体定位、基因结构、保守结构域、顺式作用元件、共线性关系和系统发育关系,并用qRT-PCR技术探究高粱PLC基因家族在不同组织时期、胁迫处理下的表达模式。结果表明,共鉴定到11个SbPLC基因,分为2个亚家族,各亚家族内的SbPLC具有典型的蛋白基序和基因结构特征,在一定程度上支持分类预测。此外,这11个SbPLC基因在高粱的6条染色体上不均匀分布并且均富集了生长发育、激素响应相关的顺式元件。通过对SbPLC共线性关系的研究发现,基因复制事件可能导致一些SbPLC基因的产生,片段复制比串联重复更有助于SbPLC基因家族的扩展。qRT-PCR结果显示,SbPLC基因不同程度地受到非生物胁迫的影响,并且在花器官、种子中的表达相对活跃。综上所述,本研究结果和信息为进一步研究高粱PLC基因的生物学功能和进化提供了良好基础,同时也为高粱的抗逆性分子育种提供了一些候选基因。
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