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二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析

文献类型： 中文期刊

作者： 许哲 1 ; 张晨光 2 ; 张思远 2 ; 王先裕 1 ; 高建昌 2 ;

作者机构： 1.广西大学

2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

关键词： 多倍体;西瓜;转录组;差异表达基因;GO富集分析;KEGG富集分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2020 年 48 卷 024 期

页码： 53-59

收录情况： 北大核心

摘要： 植物染色体加倍后的表型变化与基因的表达密切相关.本研究对1份二倍体和3份四倍体西瓜材料进行转录组测序并分析差异表达基因.结果表明,二倍体和四倍体西瓜的差异表达基因显著富集的GO term为细胞氮化合物生物合成过程、光系统、半胱氨酸型内肽酶抑制剂活性、氧化还原酶活性以及类囊体等,KE GG富集分析中发现差异表达基因在光合作用、光合作用天线蛋白、叶绿素和卟啉代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等通路较为活跃.二倍体和四倍体西瓜中高水平差异基因大都是上调表达,氧化应激蛋白、脱落酸受体、乙烯响应转录因子等差异表达基因可能是西瓜多倍体形成的关键因子,对相关基因的深入研究有助于解析植物倍性变化的分子机制.

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