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醉马草DNA提取方法的对比与优化

文献类型: 中文期刊

作者: 陈雅琦 1 ; 苏楷淇 1 ; 李春杰 1 ;

作者机构: 1.兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室/兰州大学草地农业教育部工程研究中心/兰州大学甘肃省西部草业技术创新中心/兰州大学草地微生物研究中心/兰州大学草地农业科技学院

关键词: 醉马草;DNA提取质量;SDS法;CTAB法;高盐法;纯化

期刊名称: 草学

ISSN: 2096-3971

年卷期: 2020 年 05 期

页码: 32-38

摘要: 醉马草是一种多年生牧草,为禾本科芨芨草属,常用于机场草坪建植和草原生态恢复,因其重要的经济与生态价值近年来被广泛研究关注。醉马草幼苗含有的酚类、蛋白质等杂质严重影响DNA的提取质量,常规技术不能很好地满足高质量的实验要求。本实验以醉马草幼苗为材料,分别采用SDS、CTAB、高盐法提取醉马草幼苗全基因组DNA。研究发现使用SDS法提取的DNA浓度为176ng·μL-1,提取率为30%,A值为1.7。使用CTAB法提取的DNA浓度为140ng·μL-1,提取率为23%,A值为1.68。使用高盐法提取的DNA浓度为37.7ng·μL-1,提取率为6%,A值为1.1。利用CTAB对提取出的DNA进一步纯化,用琼脂糖凝胶电泳和超微量分光光度计检测DNA的浓度和纯度,通过PCR分析验证优化后CTAB法提取DNA的效果。结果表明各方法纯化后的DNA浓度为:SDS法(223ng·μL-1)﹥CTAB法(219ng·μL-1)﹥高盐法(77ng·μL-1); A值为:SDS法(1.8)>CTAB法(1.77)﹥高盐法(1.4),其中DNA浓度较纯化前分别提高27.1%(SDS法)、57.1%(高盐法)、51.0%(CTAB法),且电泳图片显示DNA条带清晰明亮,无明显拖尾现象。因此,三种方法间使用SDS法提取DNA的效果最佳,且加入纯化步骤可进一步提高DNA提取质量。本研究旨在为醉马草的分子生物学研究提供技术支持与科学依据。

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