文献类型： 中文期刊

作者： 朱琳 ¹ ; 李维肖 ² ; 汪杰 ² ; 吴珏 ² ; 刘海霞 ³ ; 米荣升 ¹ ; 万双秀 ⁴ ; 李宗杰 ¹ ;

作者机构： 1.中国农业科学院上海兽医研究所

2.上海市奉贤区汇贤中学

3.北京华元生物技术研究院

4.菏泽学院药学院

关键词： 警犬;肠道菌群;高通量测序;拉布拉多巡回犬;比利时马里努阿犬

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2024 年 32 卷 005 期

页码： 39-48

摘要： 本研究通过对比分析拉布拉多巡回犬(Labrador Retriever)和比利时马里努阿犬(Belgian Malinois)的肠道菌群，旨在探寻与警犬的生长发育和工作性能相关的关键性微生物物种。采用高通量测序技术对两种警犬的肠道菌群的16S rRNA基因进行测序，然后利用生物信息学分析技术对比研究两个品种警犬肠道的微生物群落结构。通过对测序数据进行降噪分析，总共获得了1 819 499条高质量的有效序列，平均测序长度为411 bp。然后通过97%的序列相似性进行操作分类单元(OUT)聚类，总共获得了包括17个门，25个纲，67个目，122个科和122个属的细菌。首先进行Alpha多样性分析，发现拉布拉多巡回犬的肠道菌群的丰度和多样性都明显高于比利时马里努阿犬，然后再通过主坐标分析(PCoA)方法进行Beta多样性分析，发现拉布拉多巡回犬和比利时马里努阿犬的肠道菌群分别形成了不同的分类簇。物种组成分析结果表明，警犬的肠道微生物在门分类水平主要是由厚壁菌门(Firmicutes，平均占比24.33%)、梭杆菌门(Fusobacteroidetes，平均占比23.45%)、拟杆菌门(Bacteroidetes，平均占比23.29%)、变形菌门(Proteobacteria，平均占比16.06%)、放线菌门(Actinobacteria，平均占比6.65%)和弯曲杆菌门(Actinobacteria，平均占比5.19%)组成；在属分类水平则是主要由梭杆菌属(Fusobacterium，平均占比22.56%)，普氏菌属(Prevotella，平均占比12.79%)、厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum，平均占比9.23%)、巨单胞菌属(Megamonas，平均占比7.25%)和棒状杆菌属(Corynebacterium，平均占比4.88%)等组成。本研究通过高通量测序技术对比分析了两个品种警犬的肠道菌群的结构特征和物种组成，可以为开发宠物益生菌等相关产品提供研究思路和数据支持。