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基于BSA-Seq技术挖掘大豆中黄622的多小叶基因

文献类型： 中文期刊

作者： 邱丽娟 1 ; 张之昊 1 ; 王俊 1 ; 刘章雄 2 ;

作者机构： 1.长江大学农学院

2.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 大豆;突变体;混池测序

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2020 年 46 卷 012 期

页码： 1839-1849

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 栽培大豆(Glycine max)叶片一般为三出复叶,也有个别品种或植株突变体产生4~7个小叶,为多小叶.复叶的形成使植物对外界环境的适应能力增强,对大豆多小叶相关基因的挖掘和研究有助于改善大豆农艺性状和产量表现.本研究从大豆栽培品种中品661的突变体库中鉴定出一个多小叶突变体——中黄622,每个复叶有4~9个小叶.利用该突变体与中品661配制组合,分别于北京和海南调查F2和F2:3植株叶片表型,结果表明,多小叶性状受1对不完全显性基因控制.采用BSA-seq方法进行定位,利用F2正常三出复叶和多小叶个体分别构建混池,测序结果与参考基因组平均比对效率为98.83%,平均覆盖深度为32.75?,基因组覆盖度为99.22%.ED方法关联分析发现,在11号染色体定位到2个区域,总长度为5.29 Mb,共包含1103个基因.根据SNP-index方法关联分析,当置信度为0.99时,在11号染色体鉴定出3个区域,总长度为3.42 Mb,共包含701个基因.2种关联分析方法同时定位的基因有690个,亲本之间存在SNP的基因有6个.本研究结果为大豆多小叶基因图位克隆奠定了基础.

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