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苎麻茎皮表达序列标签(ESTs)分析

文献类型: 中文期刊

作者: 佘玮 1 ; 邢虎成 1 ; 秦占军 2 ; 罗中钦 2 ; 揭雨成 1 ;

作者机构: 1.湖南农业大学苎麻研究所

2.中国农业科学院麻类研究所

关键词: 苎麻;茎皮;表达序列标签(EST)

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2008 年 29 卷 02 期

页码: 198-201

收录情况: CSCD

摘要: 以生长中期的苎麻[Boehmeria nivea(L.) Gaud]茎皮为材料,构建库容量为2.2×105pfu/mL的cDNA文库并随机挑选部分克隆进行测序和生物信息学初步分析,得到275条有效序列。通过与NCBI等数据库比对分析,获得已知功能基因或具推测功能基因的EST91条,已知EST37条,新的EST147条,具已知或推测功能的ESTs大致分为9类,其中与蛋白质合成有关的ESTs所占比例最大。cDNA文库的构建和ESTs分析为苎麻功能基因组学研究提供了一条方便快捷的途径。

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