文献类型: 中文期刊
作者: 吕雪峰 1 ; 许艳丽 1 ; 胡昕 1 ; 赛迪古丽·赛买提 1 ; 王乐 1 ;
作者机构: 1.新疆畜牧科学院畜牧业质量标准研究所
关键词: 北山羊;绒山羊;杂交F1代;DQA1;多态性;蛋白序列分析;生物信息学
期刊名称: 黑龙江畜牧兽医
ISSN:
年卷期: 2021 年 004 期
页码: 49-54,154-155
收录情况: 北大核心
摘要: 为了解北山羊杂交后代DQA1基因序列特征,以及DQA1基因多态性与血液免疫性状的关系,筛选出用于北山羊杂交后代抗病育种的遗传标记,试验通过PCR扩增和测序获得了北山羊与家养绒山羊杂交F1代DQA1基因CDS区,并对CDS区编码蛋白进行了生物信息学预测分析,同时采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析DQA1基因外显子2的多态性,并与血液免疫性状进行了相关分析。结果表明:杂交F1代DQA1基因外显子2经AluⅠ酶切后共检出3种基因型,其中AC型白细胞和淋巴细胞数量显著高于BB型(P<0.05),AB型血红蛋白浓度显著高于BB型(P<0.05);DQA1基因CDS区长度为768 bp,编码255个氨基酸,表现为弱的亲水性,第23,24位氨基酸存在信号肽剪切位点,第218~240位有一个典型的跨膜螺旋区,二级结构主要由α-螺旋(16.08%)、β-折叠(25.49%)和无规卷曲(58.43%)组成。说明DQA1基因AC基因型与血液白细胞和淋巴细胞总数具有一定的相关性,其编码蛋白的生物信息学预测与其功能相一致,可作为抗病育种的遗传标记。
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