您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

木香花抗黑斑病基因RbRdr1的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 范元兰 1 ; 张真建 1 ; 陈宇春 1 ; 蹇洪英 1 ; 晏慧君 1 ; 张颢 1 ; 周宁宁 1 ; 王其刚 1 ; 邱显钦 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所

关键词: 木香花;黑斑病菌;RbRdr1基因;RACE技术;生物信息学分析;实时荧光定量PCR

期刊名称: 植物生理学报

ISSN: 2095-1108

年卷期: 2020 年 012 期

页码: 2716-2724

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 月季黑斑病是由真菌蔷薇盘二孢(Marssonina rosae)引起的。本研究以高抗黑斑病菌的野生种木香花(Rosa banksiae)作为实验材料,采用TA克隆法和RACE技术,克隆获得抗黑斑病候选基因RbRdr1 (GenBank登录号MK584935),并对其进行相关生物信息学分析。序列分析结果显示, RbRdr1含有1个3 396 bp的完整的开放阅读框,能编码1 131个氨基酸;其编码的蛋白是一个亲水性蛋白,亚细胞定位于线粒体及过氧化物酶体上,不具有信号肽及跨膜结构域。氨基酸同源序列多重比对发现,该基因与野蔷薇(R.multiflora)和玫瑰(R.rugosa)具有较高的同源性,其中与野蔷薇同源性为86%,玫瑰同源性为84%。实时荧光定量PCR结果表明,该基因在木香花不同组织中均有表达且存在组织特异性,在幼叶及成熟叶中的表达量相对较高,在根、茎及花瓣中的表达量相对较低。RbRdr1基因在受黑斑病菌侵染不同时期的成熟叶片中,其相对表达量均表现为诱导积极上调,且在侵染6 h最高。综上, RbRdr1基因可能参与了木香花与黑斑病菌早期的互作过程。

  • 相关文献

[1]苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析. 尹桂芳,段迎,杨晓琳,蔡苏云,王艳青,卢文洁,孙道旺,贺润丽,王莉花. 2022

[2]月月粉TGAs基因结构及RcTGA2抗灰葡萄孢菌功能分析. 高鹏华,张颢,晏慧君,陈宇春,范元兰,鄢波,邱显钦. 2021

[3]云南木香花天然居群的表型多样性研究. 陈玲,张颢,邱显钦,蹇洪英,李树发,王其刚,唐开学. 2010

[4]金银花DNA去甲基化酶基因的生物信息学分析. 齐琳洁,袁媛,伍翀,黄璐琦,陈平. 2015

[5]中华蜜蜂气味受体基因AcerOR113的克隆与时空表达分析. 杜亚丽,王树杰,赵慧婷,潘建芳,杨爽,郭丽娜,徐凯,姜玉锁. 2017

[6]甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析. 李旭娟,林秀琴,刘洪博,李纯佳,徐超华,刘新龙. 2015

[7]家蚕B型清道夫受体基因的鉴定及系统发生与表达分析. 柴春利,代方银,潘敏慧,杜周和,胡海,鲁成. 2010

[8]甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析. 李旭娟,刘洪博,林秀琴,吴转娣,徐超华,刘新龙. 2015

[9]白叶枯病菌胁迫下云南普通野生稻SSH文库的构建及抗病相关基因分析. 蒋春苗,程在全,孙正文,李定琴,余腾琼. 2013

[10]甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息学分析. 吕爱丽,李旭娟,刘洪博,吴才文,曾千春,刘新龙. 2016

[11]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021

[12]百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析. 王浩,孙亮,张济民,贾文杰,吴雅文,张小平,李想,王有国. 2022

[13]滇龙胆环烯醚萜氧化酶基因及启动子的克隆与生物信息学分析. 张晓东,李彩霞,赵青蓉,王元忠. 2018

[14]紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析. 刘悦,曲浩,尚卫琼,孙云南,田易萍,仝佳音,陈林波. 2020

[15]滇龙胆乙酰CoA转移酶基因的克隆与表达分析. 张晓东,李彩霞,王连春,王元忠. 2016

[16]番茄环纹斑点病毒(TZSV)实时荧光定量PCR检测方法的建立. 徐弢,郑雪,张晓林,陈永对,穆野,陈勇,郑宽瑜,赵立华,刘小烛,张洁. 2017

[17]致病菌与非致病菌诱导对家蚕抗菌肽基因defensinA/B的表达定量分析. 唐芬芬. 2013

[18]饥饿对家蚕DefensinA和DefensinB表达水平的影响. 杨伟克,唐芬芬,刘增虎,钟健,董占鹏. 2016

[19]滇南中蜂蜂王卵黄原蛋白基因实时荧光定量PCR的建立. 陈顺安,宋文菲,王艳辉,罗卫庭. 2014

[20]1-脱氧野尻霉素对家蚕中肠BmSuc1基因表达及其酶活性的影响. 杨伟克,唐芬芬,刘增虎,钟健,董占鹏. 2016

作者其他论文 更多>>