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棉花HDAC基因家族鉴定及其在黄萎病菌侵染下的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王艳情 1 ; 郑杰 1 ; 许艳超 1 ; 蔡小彦 1 ; 周忠丽 1 ; 侯宇清 1 ; 王坤波 1 ; 王玉红 1 ; 陈浩东 1 ; 刘方 1 ; 李志坤 1 ;

作者机构: 1.河北农业大学/华北作物改良与调控国家重点实验室;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室

关键词: 棉花;HDAC;抗黄萎病;全基因组家族鉴定;基因表达

期刊名称: 棉花学报

ISSN: 1002-7807

年卷期: 2021 年 006 期

页码: 469-481

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HDAC)在植物发育及抗病应答中发挥重要作用,本研究旨在鉴定棉花HDAC基因家族成员并对其在黄萎病抗性中的作用进行分析。【方法】利用生物信息学方法对棉花基因组中HDAC基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、系统发育关系、基因结构进行系统分析。利用实时荧光定量聚合酶链式反应分析了黄萎病菌诱导下瑟伯氏棉HADC基因的表达模式。【结果】陆地棉、亚洲棉和瑟伯氏棉基因组中分别包括30、15和13个HDAC基因。棉花HDAC分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2三个亚族,同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序。棉花HDACs基因启动子中含有大量的激素应答、胁迫响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件。瑟伯氏棉GthHDAC基因响应乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导;在黄萎病菌胁迫下,多数GthHDAC基因上调表达,表明该基因家族可能通过乙烯/茉莉酸和水杨酸等信号通路调控棉花黄萎病抗性。【结论】本研究从全基因组水平上鉴定了亚洲棉、陆地棉和瑟伯氏棉中58个HDAC家族基因,并明确了瑟伯氏棉HDAC家族成员在黄萎病菌胁迫下的表达模式。黄萎病菌处理后,大部分Gth HDAC基因在叶片中上调表达,并且受到乙烯、水杨酸和茉莉酸的诱导。

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