文献类型： 中文期刊

作者： 谢小燕 ¹ ; 苏晓娜 ¹ ; 王惠梅 ¹ ; 江绍琳 ¹ ; 吴建利 ¹ ; 江绍玫 ¹ ;

作者机构： 1.江西财经大学艺术学院;江西农业大学南昌商学院;中国水稻研究所;江西农业大学农学院;江西财经大学统计学院

关键词： 野生菰;ISSR分子标记;遗传多样性;琼脂糖凝胶电泳;聚丙烯酰胺凝胶电泳;华东地区

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2019 年 12 期

页码： 2638-2646

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】筛选更优的ISSR-PCR扩增产物电泳检测方法,分析我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性,为建立和完善菰植物种质库及合理开发与利用菰资源提供理论依据。【方法】挑选7条ISSR引物对华东地区9个野生菰居群104份材料基因组DNA进行PCR扩增,其ISSR-PCR产物分别采用2%琼脂糖凝胶电泳和5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测。【结果】2%琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的多态性位点百分率(PPB)为63.49%、观测等位基因数(Na)为1.6349、有效等位基因数(Ne)为1.3012、Nei’s基因多样性指数(He)为0.1871、Shannon’s信息指数(I)为0.2908、居群间遗传分化系数(Gst)为0.3922、遗传相似系数(Gs)变化范围在0.8293～0.9775;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.885时,9个野生菰居群被分为两大类,SH(上海)和PYH(鄱阳湖)居群归为一类,其他7个居群归为另一类。5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的PPB为78.03%、Na为1.7803、Ne为1.2762、He为0.1804、I为0.2914、Gst为0.5086、Gs变化范围在0.7679～0.9837;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.850时,9个居群也被分为两大类,其中PYH居群单独为一类,其他8个居群归为另一类。【结论】我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性丰富,居群间和居群内变异显著,基于ISSR分子标记的野生菰遗传多样性采用5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测可获得更可靠的遗传图谱,而2%琼脂糖凝胶电泳检测更适合早期的ISSR分子标记引物筛选。