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小麦矮腥黑粉菌效应蛋白g10613的基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭志浩 1 ; 高利 1 ; 刘琦 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室;新疆农业大学农学院/农林有害生物监测与安全防控重点实验室

关键词： 小麦矮腥黑粉菌;g10613;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 新疆农垦科技

ISSN： 1001-361X

年卷期： 2023 年 46 卷 002 期

页码： 53-55

摘要： 本研究重点分析小麦矮腥黑粉菌的g10613基因编码效应蛋白的生物学功能.根据小麦矮腥黑粉菌基因组测序结果,筛选出编码效应蛋白基因g10613作为主要研究对象.将效应蛋白基因g10613成功克隆,并运用多种生物信息学数据库,解析了该蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、亲疏水性以及信号肽.结果表明:g10613基因全长330 bp,共编码109个氨基酸;它所编码的效应蛋白质没有明显的家族结构特征;该蛋白质中亲水的氨基酸数量更多,是偏亲水蛋白质;在跨膜区分析中,它存在一个跨膜区,处于0~23氨基酸的位置.

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