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基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术优化及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 石佳 1 ; 朱秀梅 1 ; 薛梦雨 1 ; 余超 1 ; 魏一鸣 1 ; 杨凤环 1 ; 陈华民 1 ;

作者机构: 1.植物病虫害生物学国家重点实验室

关键词: 水稻原生质体;染色质免疫共沉淀技术;转录因子;OsNF-YA4;ChIP-RP

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2022 年 007 期

页码: 62-69

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 植物转录因子是植物体内调节基因表达的重要蛋白,参与多种生物学功能的调控。研究植物转录因子调控靶基因的常用方法为染色质免疫共沉淀法(chromatin immunoprecipitation,ChIP),但抗体特异性、遗传材料构建的耗时性等因素却大大限制了ChIP技术的应用范围和效果。本文通过对水稻原生质体瞬时转化、甲醛固定、免疫沉淀核酸的超声波破碎等条件的优化,建立了基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术体系(chromatin immunoprecipitation system based on rice protoplasts,ChIP-RP);并通过本技术体系验证了水稻转录因子OsNF-YA4蛋白对靶基因序列的富集作用。本技术体系将减少制备特异性抗体或构建稳定遗传材料的局限,有利于水稻转录因子直接调控靶基因的快速筛选和验证,推动水稻转录因子调控功能的分子机制解析。

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