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石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 骆翔 1 ; 曹尚银 1 ; 李好先 1 ; 赵弟广 1 ; 张富红 1 ; 陈丽娜 1 ; Krishna Poudel 1 ; 敬丹 1 ; 唐丽颖 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院郑州果树研究所

关键词： 石榴;SUT;基因家族;籽粒;表达分析

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2020 年 004 期

页码： 485-494

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考.[方法]利用同源比对及HMMER模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系.[结果]共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显正相关;石榴SUT基因启动子区含有10种MYB元件;此外,4个石榴SUT基因(PgL0328370.1、PgL0099690.1、PgL0145810.1和PgL0145770.1)在籽粒发育过程中发生了差异表达.[结论]SUT基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关.

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