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激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 林嘉鹏 1 ; 吴阳升 2 ; 韩冰 2 ; 李晓林 2 ; 汪立芹 2 ; 刘明军 2 ; 黄俊成 2 ;

作者机构: 1.农业部草食家畜遗传育种与繁殖重点开放实验室新疆维吾尔自治区畜牧科学院生物技术研究所

2.农业部草食家畜遗传育种与繁殖重点开放实验室

关键词: 绵羔羊;成年母羊;microRNA;卵泡

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2018 年 011 期

页码: 2423-2430

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]通过small RNA高通量测序技术,筛选绵羔羊和成年母羊差异表达miRNA,进一步挖掘和鉴定与卵泡发育相关的相关基因,揭示其性状差异的信号通路及分子调控网络.[方法]以绵羔羊和成年母羊颗粒细胞为研究对象,应用高通量测序技术进行small RNA文库构建,获得miRNA表达谱,鉴定差异表达miRNA,进而对这些差异表达miRNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集等.[结果]从2个样本miRNA库鉴定出238个已知miRNAs和79个新miRNAs.共获得9个差异miRNA,与成年羊相比,羔羊有4个miRNA上调,5个下调.其中,oar-miR-106a上调倍数最大(1. 85),oar-miR-10a下调最为显著(-2. 20).对差异miRNAs进行GO富集和KEGG通路富集分析表明,新陈代谢途径富集的基因最多.利用qRT-PCR对5个随机挑选的miRNA进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠.[结论]miRNAs可能在激素处理后对绵羊生殖生理中起着重要的作用,包括卵泡和卵母细胞的发育,颗粒细胞的增殖等.

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[1]激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析. 林嘉鹏,吴阳升,韩冰,李晓林,汪立芹,刘明军,黄俊成. 2018

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[6]Genome-wide sequencing of small RNAs reveals a tissue-specific loss of conserved microRNA families in Echinococcus granulosus. Bai, Yun,Jin, Lei,Kang, Hui,Zhu, Yongqiang,Zhang, Lu,Li, Xia,Ma, Fengshou,Wang, Shengyue,Zhang, Zhuangzhi,Zhao, Li,Shi, Baoxin,Li, Jun,Zhang, Wenbao,McManus, Donald P.. 2014

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