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利用Bayesian-MCMC方法进行畜禽复杂离散性状QTL定位

文献类型： 中文期刊

作者： 刘剑锋 1 ; 张沅 2 ; 张勤 2 ; 王立贤 2 ; 张纪刚 2 ;

作者机构： 1.中国农业大学动物科技学院

2.中国农业大学动物科技学院,中国农业科学院畜牧研究所 北京 100094,中国农业大学动物科技学院,中国农业大学动物科技学院,中国农业科学院畜牧研究所,中国农业大学动物科技学院,,北京 100094,北京 100094,北京 100094,北京 100094,北京 100094

关键词： 复杂离散性状;QTL定位;Bayesian-MCMC方法;远交群体;IBD方差组分随机模型

期刊名称： 中国科学C辑:生命科学

ISSN： 1006-9259

年卷期： 2006 年 36 卷 03 期

页码： 240-246

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 复杂离散性状由于表型数据呈离散分布并且提供信息量过小,因此很难用常规的统计方法对此类性状的QTL进行定位研究．Bayesian-MCMC方法是复杂离散性状QTL定位的重要手段,该方法通过所有先验信息来推导QTL参数的后验分布并利用Markov Chain随机过程进行抽样的方法对目标参数进行统计推断．利用Monte Carlo方法,针对畜禽远交群体模拟产生多个全同胞家系的2级分类复杂离散性状,然后基于IBD方差组分的随机模型的定位策略,同时利用MCMC的3种不同抽样技术(Gibbs抽样、Metropolis抽样和Reversible Jump MCMC抽样)产生相应QTL参数的后验样本,并进行了目标参数的Bayesian统计推断．结果表明:Bayesian-MCMC方法能够对不同家系结构和QTL效应水平下复杂离散性状QTL进行有效检测;当家系含量增加时, QTL定位的精确性和准确性提高,并可适用于效应更小QTL的检测．

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[2]利用Bayesian-MC MC方法进行畜禽远交群多家系离散性状QTL连锁检测. 刘剑锋,王立贤,张沅,张勤. 2005

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