文献类型： 中文期刊
作者： 王琳琳 1 ; 赵永平 1 ; 张从省 1 ; 杨海龙 1 ; 王宏伟 1 ; 谢传晓 1 ;
作者机构： 1.沈阳农业大学特种玉米研究所;中国农业科学院作物科学研究所;中国农业科学院生物技术研究所;安徽农业大学生命科学院
关键词： 玉米;microRNA;深度测序;RNA seq;差异分析
期刊名称： 玉米科学
ISSN： 1005-0906
年卷期： 2018 年 05 期
页码： 30-36
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 基于HiSeq高通量测序技术并结合生物信息学方法对X178、掖478两种材料授粉前后两个时期穗已知miRNA及靶基因进行分析。结果发现,X178授粉前后差异表达miRNA有100个,分别属于21个miRNA家族;掖478授粉前后共筛选出98个有差异的miRNA,分别属于22个miRNA家族。利用miRNA与靶基因mRNA负调控关系初步确定授粉前后miRNA可能调控的mRNA靶点,建立miRNA-靶mRNA一一对应关系。结果表明,X178中上调表达的13个miRNA对应11个下调表达靶基因,下调表达的33个miRNA对应41个上调表达靶基因;掖478中上调表达的5个miRNA对应7个下调表达靶基因,下调表达的28个miRNA对应33个上调表达靶基因,其中,6个miRNA家族共靶向11种mRNA。研究结果表明,在授粉前后玉米穗中已知miRNA在不同玉米自交系中种类具有差异。
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