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甘蔗组培苗2种污染细菌的分离与鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 刘红坚 1 ; 李松 1 ; 何为中 1 ; 刘俊仙 1 ; 刘丽敏 1 ; 卢曼曼 1 ; 游建华 1 ; 黄诚华 1 ; 林善海 1 ;

作者机构： 1.广西农业科学院甘蔗研究所/中国农业科学院甘蔗研究中心/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室

关键词： 甘蔗;组培苗;污染细菌;芽孢杆菌;系统发育树

期刊名称： 热带作物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 519-526

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 细菌污染是甘蔗组培苗生产上的一个主要问题。为明确甘蔗组培中常出现的污染细菌的种类,本研究通过梯度稀释的方法分离污染细菌,结合生化特性、16S rRNA和phaC基因序列比对及系统发育分析鉴定其分类地位。结果表明,共分离获得2种不同类型污染细菌,除了甘露醇,其余9个生化指标完全一致。基因序列比对发现,2种类型分离物的种内2个基因序列完全一致,而种间16SrRNA序列只有2个碱基差异,种间phaC序列有23个碱基差异。2个基因序列构建的系统发育树显示,2种细菌遗传距离较近,并均能形成独立的2个分支。结合生化特征、序列比对及系统发育树,将2种污染细菌分别鉴定为巨大芽孢杆菌（Bacillus megaterium）和阿氏芽孢杆菌（B. aryabhattai）,且首次报道阿氏芽孢杆菌为甘蔗组织培养中的污染细菌。本研究揭示了巨大芽孢杆菌可能来源于甘蔗的内生菌,而阿氏芽孢杆菌来源于环境。

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