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玉米株高QTL的定位及主效QTL的确认

文献类型： 中文期刊

作者： 高歌 1 ; 杨媛 2 ; 郑军 3 ; 张红伟 3 ;

作者机构： 1.吉林农业大学农学院

2.中国农业大学农学与生物技术学院

3.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 玉米;株高;关联分析;QTL

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2022 年 36 卷 008 期

页码： 1530-1536

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探索玉米株高的遗传机制,定位玉米株高的数量性状位点(QTL),本研究以玉米自交系PH4CV为轮回亲本,以郑58为供体亲本,构建BC1F3:4分离群体,在4个环境下对该群体进行玉米株高表型鉴定.表型分析结果表明,基因型之间差异极显著,且不同环境之间的株高相关性极显著,说明不同环境之间的株高变异具有共同的遗传基础.利用包含5.5万个单核苷酸多态性标记(SNPs)的基因芯片进行基因型鉴定,并结合基因型和表型数据进行全基因组关联分析.在错误发现率(FDR)为0.05时,检测到10个显著性SNPs,这些显著性SNPs主要位于第2号染色体上,-log10(P)值最大的标记为Chr2_194690794.利用线性回归模型对显著SNPs进行表型贡献率及效应分析,发现位于第2号染色体的标记Chr2_194690794效应值最大,贡献率最高,来源于PH4CV的基因型的正效应.利用BC1F5:6群体进行基因型和表型鉴定,进一步确认了标记Chr2_194690794与株高QTL的连锁关系,表明在第2号染色体上存在1个控制株高的QTL.本研究为玉米株高QTL的精细定位奠定了基础.

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