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对萼猕猴桃CDPK基因家族鉴定及非生物胁迫应答分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张永杰 1 ; 白丹凤 1 ; Muhammad Abid 1 ; 李志 1 ; 方金豹 1 ; 钟云鹏 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院郑州果树研究所

关键词： 对萼猕猴桃;全长转录组;CDPK基因家族;盐胁迫;淹水胁迫

期刊名称： 果树学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 1653-1667

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】鉴定对萼猕猴桃（Actinidia valvata）CDPK家族基因,并分析其在不同组织的表达模式以及对盐胁迫和淹水胁迫的响应。【方法】基于3代全长转录组测序数据,通过多种生物信息学手段,分析和鉴定对萼猕猴桃CDPK家族基因,利用实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,qRT-PCR）技术分析这些基因在不同组织中的表达,及在不同非生物胁迫条件下的表达情况。【结果】在对萼猕猴桃基因型KR5的全长转录组测序数据中共鉴定出63个CDPK基因,命名为AvCDPK1～AvCDPK63。系统发育分析将AvCDPK基因蛋白分为4个亚家族,同一亚家族具有相似的结构和基序（motif）。AvCDPK基因存在明显的组织表达特异性。AvCDPK49在盐胁迫和淹水胁迫条件下,均显著诱导表达,Av CDPK30和31在2种胁迫下均显著抑制表达。【结论】在对萼猕猴桃中共鉴定出63个CDPK基因,系统发育树显示Av CDPK基因家族与拟南芥CDPK基因家族在进化上高度保守。不同组织中AvCDPK的表达量存在明显差异,其中Av CDPK49受盐害、淹水诱导显著高表达,表明其可能在猕猴桃的耐盐和耐涝响应过程中发挥着重要作用。

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