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基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王涛 1 ; 扈艳萍 2 ; 朱华 1 ; 张子君 1 ; 邹庆道 1 ;

作者机构： 1.辽宁省农业科学院

2.辽宁职业学院农艺学院

关键词： 番茄;遗传多样性;SNP;SSR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 015 期

页码： 5143-5149

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析不同番茄种质的遗传多样性,利用120个SNP和29个SSR标记对210份番茄自交系进行基因分型.结果表明,SSR具有较高的多态性,而SNP检测到更高的基因多样性.在预先划分的3个亚群中,樱桃番茄遗传变异最高,常规番茄品种次之,现代番茄品系最低,说明早期育成的番茄品种仍具有较为丰富的遗传多样性.群体结构分析发现,SNP可将3个亚群区分开,同时常规番茄进一步分为粉果番茄和红果番茄2个小亚群.SSR的分析结果与SNP和预先的分类并不一致,未能将常规番茄和现代品系完全区分开.遗传距离分析显示,SNP具有更高的分辨率,可以区分所有供试材料,有6对材料组合未被SSR数据区分开.总的来说,在栽培番茄遗传多样性分析中,SNP标记具有更高的效率.

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