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钝裂银莲花花色素合成相关基因qRT-PCR内参基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 马璐琳 1 ; 段青 1 ; 崔光芬 1 ; 杜文文 1 ; 贾文杰 1 ; 王祥宁 1 ; 王继华 1 ; 陈发棣 2 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院花卉研究所云南省花卉育种重点实验室国家观赏园艺工程技术研究中心

2.南京农业大学园艺学院

关键词: 钝裂银莲花;实时荧光定量PCR;内参基因;筛选;稳定性;类黄酮/花青素合成途径

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 377-388

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了筛选适合于钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中相关基因q RT-PCR表达分析时的内参基因,根据钝裂银莲花蓝/白不同花色花器官组织的转录组测序结果,选取了多聚泛素酶基因(polyubiquitin,UBQ)、微管蛋白基因(β-tubulin,β-TUB)、水通道蛋白基因(aquaporin,AQP)、肌动蛋白基因(actin,ACT)、甘油醛–3–磷酸–脱氢酶基因(glyceraldehyde-3-phosphatedehydrogenase,GAPDH)、组蛋白基因(histone,HIS)、转录延伸因子基因(elongation factor 1-β,EF-1β)和60S核糖体蛋白基因(60S ribosomal protein L13-1,RPL13)等8个常用内参基因作为候选基因,以钝裂银莲花的叶片、茎杆和蓝/白色花器官等不同组织为试验材料,通过qRT-PCR检测这8个候选内参基因的表达情况,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper等软件对其稳定性进行分析评价。结果表明:8个候选内参基因中,UBQ表现最稳定,而β-TUB相对稳定性最差。以最稳定的UBQ为内参对钝裂银莲花类黄酮/花青素合成途径中16个相关基因表达情况进行q RT-PCR分析,结果与前期转录组测序结果一致。UBQ为钝裂银莲花花色素合成途径相关基因表达分析的最适内参基因。

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