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基于DPO引物检测猪流行性腹泻病毒荧光定量RT-PCR方法的建立及初步应用

文献类型: 中文期刊

作者: 王以欣 1 ; 王紫薇 1 ; 汉武娇 1 ; 王丽 1 ; 姜艳平 1 ; 崔文 1 ; 周晗 1 ; 乔薪瑗 1 ; 唐丽杰 1 ; 李一经 1 ; 徐义刚 1 ;

作者机构: 1.东北农业大学动物医学学院;农业部动物疫病病原生物学重点实验室/东北科学观测实验站

关键词: 猪流行性腹泻病毒;DPO引物;荧光定量RT-PCR

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2019 年 07 期

页码: 710-715

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立快速、准确检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)的方法,本研究以PEDV的N基因为靶基因,基于双启动寡核苷酸引物(DPO),经过条件优化,建立了检测PEDV的荧光定量RT-PCR方法。结果显示,DPO引物的有效退火温度范围较宽(45℃~65℃);在测试的10种病毒中仅PEDV为阳性扩增结果,其余病毒为阴性结果,特异性较强;对PEDV质粒标准品的检测限可达1.64×10~1拷贝/μL,敏感性较高;组内、组间重复性结果的变异系数均小于1%,重复性较好。利用该方法对采集的272份临床仔猪腹泻样品(粪便、小肠组织)进行检测,结果显示,共检出PEDV阳性样品39份,阳性率为14.34%,与常规RT-PCR方法检测结果的阳性符合率为92.31%;本研究建立方法检测的阳性样品经PEDV N基因测序鉴定,确实均为PEDV阳性样品。本研究建立的基于DPO引物检测PEDV的荧光定量RT-PCR方法为PEDV的准确检测和流行病学调查提供技术支持。

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