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猪嵴病毒CH441株VP1基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 祝俊鹏 1 ; 杨彬 2 ; 兰喜 2 ; 柳纪省 2 ; 马小军 1 ;

作者机构： 1.甘肃农业大学

2.中国农业科学院

关键词： VP1基因;克隆;DNA测序;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2015 年 30 卷 02 期

页码： 72-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了深入研究嵴病毒(sw Ko V)主要结构蛋白基因VP1,根据Gen Bank中已发表的猪嵴病基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增猪嵴病毒CH441株VP1基因,并对其进行克隆与测序分析。结果表明,sw Ko V CH441株的VP1基因为762 bp,与Gen Bank已发表的嵴病毒属的15株嵴病毒序列的VP1基因相比较,sw Ko V CH441株的VP1基因与其他各毒株VP1基因的核苷酸同源性为81.5%~90.2%,氨基酸同源性为86.6%~96.9%,进化分析显示,sw Ko V CH441株与GS-1株之间的亲缘关系较近。生物信息学分析显示,VP1蛋白理论等电点(p I)为4.40,理论分子质量为26.978 2 k Da;其序列上共发现18个磷酸化位点,分别为Ser(7)、Thr(6)和Tyr(5),而蛋白的磷酸化与信号转导有关,预测该蛋白为一重要的信号转导分子;无信号肽和跨膜区。为进一步开展sw Ko V CH441株VP1基因在遗传变异等方面的研究奠定了理论基础。

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