文献类型： 中文期刊

作者： 赵保才 ¹ ; 赵帅阳 ² ; 关贵全 ² ; 罗建勋 ² ; 曹天行 ² ; 张志刚 ² ; 石苗 ² ; 刘军龙 ² ; 赵洪喜 ¹ ;

作者机构： 1.宁夏大学农学院

2.中国农业科学院兰州兽医研究所/家畜疫病病原生物学国家重点实验室/甘肃省动物寄生虫病重点实验室

关键词： 环形泰勒虫;牛单核细胞;转录组;信号通路

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2022 年 012 期

页码： 4398-4409

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本试验主要通过研究布帕伐醌（BW720）处理前后，环形泰勒虫转化牛单核细胞（TaNMⅠ）转录组数据的变化情况，为进一步研究环形泰勒虫诱导宿主细胞转化的分子机制奠定基础。以环形泰勒虫感染的牛单核细胞为试验材料，设置对照组（二甲基亚砜，DMSO）和试验组（BW720）,利用Illumina HiSeq4000测序平台进行高通量测序，将测序得到的原始数据（Raw reads）与GenBank和Rfam数据库进行比对过滤，通过质控获得最终数据（Clean read）。利用Venn分析软件筛选出DMSO组和BW720组中差异表达明显的基因，进行功能注释（GO）以及信号通路（KEGG）分析。随机选择10个基因，利用荧光定量PCR（qPCR）检测基因在不同处理条件下细胞中的表达量。在验证测序结果的准确性后，选出差异表达明显的基因，分析其在TaNMⅠ细胞的凋亡、增殖等信号通路方面的作用。结果显示：BW720组和DMSO组中分别得到6 854 019 704和6 627 265 854条Raw reads,过滤、质控后分别得到22 925 606和22 171 427条Clean reads。BW720组和DMSO组中筛选出差异表达明显的基因共计4 054个（P＜0.05）,其中，2 146个基因显著上调，1 908个基因显著下调；进一步筛选出共同差异表达的基因367个，其中，显著上调的196个，显著下调的171个。同时，qPCR验证随机选择10个基因的表达趋势与转录组测序结果一致，表明测序结果可靠。然后对差异表达基因进行GO功能注释，筛选到与细胞增殖相关的20个生物学过程、15个细胞组分以及11个分子功能条目。KEGG富集分析结果显示，在Top20的信号通路中筛选出与环形泰勒虫转化细胞有关的一些信号通路，如：癌症信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。对这些信号通路进一步分析发现：PI3KR3、FOXO1、IL23A、FZD3、AKT、MMP9等基因在环形泰勒虫转化细胞的研究中也有相关文献的报道。本研究表明，在TaNMⅠ细胞中DAPK1、FZD3、FOXO3、PI3KR3等可能在感染细胞无限增殖的过程中发挥作用，为后续研究TaNMⅠ细胞无限增殖机制奠定了基础。