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生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族

文献类型: 中文期刊

作者: 朱宗文 1 ; 张爱冬 1 ; 吴雪霞 1 ; 查丁石 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院园艺研究所

关键词: 脂肪酸去饱和酶(FAD);茄子(Solanum melongena L.);基因家族

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2023 年 008 期

页码: 2453-2463

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 脂肪酸去饱和酶(FAD)广泛分布于生物体内,其主要功能是在脂肪酸的生物合成过程中,从碳链中去除氢,从而产生碳碳双键。利用拟南芥FAD家族基因和茄子基因组数据,对茄子基因中可能含有的FAD基因进行鉴定和生物信息学分析。共鉴定出茄子FAD基因家族成员38个,其中FAB亚家族成员5个。对家族成员进行蛋白理化性质分析、系统进化分析和保守结构域分析,发现各亚家族成员间具有较为相似的保守基因序列和蛋白特性;基因结构分析表明,FAD家族成员间存在着不同的基因结构,但聚为一类的亚家族基因具有进化的保守性;染色体定位显示茄子FAD家族成员主要分布在5号染色体、6号染色体和4号染色体上。亚细胞定位预测茄子FAD家族成员主要分布在内质网、叶绿体和质膜上,FAB亚家族则全部定位在叶绿体上。

  • 相关文献

[1]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021

[2]茄子品种'绿秀丽'青茄纯度鉴定的SSR标记筛选. 谭枫,朱宗文,刘晓慧,张爱冬,尚静,查丁石,吴雪霞. 2023

[3]基因组水平上杨树NAC基因家族的初步分析. 蔡斌,周军,李成慧,彭日荷,熊爱生,高峰,姚泉洪,章镇. 2009

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