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基因加倍对棉花线粒体atpA基因RNA编辑率的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 张晓 1 ; 李才华 1 ; 王婧 1 ; 张兰兰 1 ; 牟晓雨 1 ; 王昕玥 1 ; 甘刘美 1 ; 周鹏展 1 ; 张锐 2 ;

作者机构: 1.长春理工大学生命科学技术学院

2.中国农业科学院生物技术研究所

关键词: 棉花;线粒体基因组;atpA;基因加倍;RNA编辑

期刊名称: 生物技术进展

ISSN: 2095-2341

年卷期: 2022 年 12 卷 005 期

页码: 737-745

摘要: 植物线粒体基因组中存在RNA编辑(C-U)现象,且有完全编辑和部分编辑之分.棉花细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterile,CMS)系和保持系线粒体基因组中atpA基因各有两个拷贝,存在基因加倍现象,但atpA基因加倍对其RNA编辑率的影响尚不清楚.通过Southern blot、染色体步移技术确定出该基因每个拷贝具体的DNA序列,发现一个拷贝是完整的,一个拷贝是截短的.用RT-PCR、环化RT-PCR方法扩增出每个拷贝相应的cDNA,结果表明:棉花CMS系和保持系atpA基因完整拷贝和截短型拷贝都转录.完整拷贝、截短型拷贝中分别存在6、4个RNA编辑位点.完整拷贝6个RNA编辑位点在保持系中的编辑率都是100%;在CMS系中编辑率分别是100%、85%、100%、92%、100%、100%.截短型拷贝4个位点在保持系中的编辑率分别是55%、37%、55%、27%;在CMS系中编辑率分别是100%、90%、100%、100%.据此推测截短型拷贝在保持系中承受选择压较小,很可能已失去功能;而在CMS系中仍承受较大选择压,很可能具有新的功能.

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