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棉花色素腺体发育相关基因GhERF105-like的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张曦 1 ; 钱玉源 1 ; 王广恩 1 ; 刘祎 1 ; 权月伟 2 ; 崔淑芳 1 ; 米换房 2 ; 李俊兰 1 ;

作者机构: 1.河北省农林科学院棉花研究所农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室国家棉花改良中心河北分中心

2.邯郸市农业科学院

关键词: 棉花;AP2/ERF转录因子;序列分析;表达分析

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2022 年 006 期

页码: 34-41

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探析GhERF105-like在棉花色素腺体发育或棉酚代谢中的功能,利用RT-PCR技术克隆了中棉所12的GhERF105-like基因,并进行了生物信息学分析及表达模式分析。结果显示,GhERF105-like编码区为711 bp,编码236个氨基酸。GhERF105-like蛋白分子质量为26.3 ku,理论等电点pI为7.72;二级结构预测存在22.88%的α-螺旋、13.14%的延伸链、3.81%的β-转角和60.17%的无规则卷曲。GhERF105-like在第91—155位氨基酸处存在1个AP2结构域,预测有2个苏氨酸、1个酪氨酸和1个丝氨酸磷酸化位点位于AP2结构域内。系统进化分析表明,GhERF105-like及其同源蛋白基序组成在不同物种中保守程度较高,GhERF105-like与黄褐棉、达尔文氏棉、雷蒙德氏棉、海岛棉中同源蛋白的基序组成一致。GhERF105-like在有腺体棉中棉所12各个组织中的表达均显著或极显著高于无腺体棉中棉所12显性无腺体;GhERF105-like在不同有腺体棉品种/系叶片中的表达量不同,且均显著高于显性或隐性无腺体棉品种/系。GhERF105-like受ABA、BR诱导显著上调表达,但在MeJA、Eth、NaCl和PEG处理下显著或极显著下调表达。综上所述,GhERF105-like与棉花色素腺体发育密切相关,可能通过ABA、BR、Eth和JA通路调控腺体发育或棉酚代谢。

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