水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马银花

作者： 马银花;刘桃梅;万天雪;肖新波;胡琼;李萍芳;段仁燕;张斌;金晨钟;杜波

作者机构：

关键词： 水稻;OsRLCK167基因;组织表达模式;生物信息学分析

期刊名称： 山东农业科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 8-14

摘要： 类受体胞质激酶（receptor-like cytoplasmic kinases, RLCKs）家族是一类特殊蛋白激酶，在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因，即OsRLCK167（LOC＿Os04g56060）。为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用，本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167基因进行生物信息学分析；采用qRT-PCR技术对OsRLCK167基因做组织表达模式分析。结果显示：OsRLCK167蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白；对该蛋白的二级结构进行预测，显示其主要由无规则卷曲（41.94%）、α-螺旋（35.29%）、延伸链（15.35%）和β-转角（7.42%）组成；该基因在水稻不同组织均有表达，且在叶鞘中的表达量最高。结果表明，OsRLCK167基因在进化过程中具有高度的保守性，在水稻中具有功能多样性。

分类号： S511

  • 相关文献

[1]中华蜜蜂感觉神经元膜蛋白基因克隆、组织表达分析及原核表达. 胡颖颖,徐书法,李薇,Abebe Jenberie WUBIE,国占宝,周婷. 2013

[2]企鹅珍珠贝组织蛋白酶D的cDNA克隆、序列特征分析和应激表达研究. 潘俐玲,黄桂菊,成书营,王晓宁,喻达辉. 2012

[3]水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析. 谭炎宁,张超,殷小林,何强,肖应辉,邓华凤. 2019

[4]水稻类受体蛋白激酶基因OsESG1的克隆与生物信息学分析. 房孝良,刘炜. 2012

[5]水稻α-NAC基因家族的克隆及生物信息学分析. 王晓静,孙林静,马忠友,孙玥,李军玲,张融雪,闫双勇,刘学军. 2016

[6]水稻OsPP6C基因的克隆、过表达载体构建与生物信息学分析. 王青云,王润青,方聪燕,侯佩,苏亮,李建平,宋梅芳,杨建平,李雪梅,吴大付. 2013

[7]抗草甘膦水稻突变体osgr-1 EPSPS基因克隆及生物信息学分析. 戴燚,赵德刚. 2018

[8]水稻赤霉素3β羟化酶基因(OsGA3ox1)同源基因的生物信息学分析. 殷小林,张超,王有成,袁定阳,谭炎宁,段美娟. 2019

[9]水稻GATA基因家族生物信息学分析. 骆鹰,王有成,王伟平,张超. 2018

[10]水稻OsVQ20基因生物信息学及表达分析. 骆鹰,何福林,李治章,张斌,刘永昌,谭炎宁,刘小文,张超. 2019

[11]水稻Cu/Zn-SOD基因的克隆、表达及生物信息学分析. 骆鹰,谢旻,张超,王伟平,朱建华,汪启明,饶力群. 2018

[12]水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析. 张琪,张爱霞,贾俊婷,赵华,刘军,陈兵先. 2022

[13]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021

[14]水稻OsNRAMP7基因的克隆、表达及生物信息学分析. 吴天昊,李曜魁,孙远涛,董家瑜,莫伊凡,唐丽,赵炳然. 2021

[15]柑橘GAST1基因的克隆及生物信息学分析. 张永艳,郝向阳,钟云,程春振. 2017

[16]谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析. 赵艳,瓮巧云,马海莲,宋晋辉,袁进成,王凌云,董志平,刘颖慧. 2016

[17]半番鸭POU1F1基因序列的克隆与生物信息学分析. 朱志明,陈晖,李盛霖,郑嫩珠,缪中纬. 2010

[18]辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析. 李涛,徐小万,黎振兴,王恒明,李植良,李颖. 2015

[19]玉米ZmHDR基因的分子克隆及生物信息学分析. 鲁晓民,王振华,张新,张前进,魏昕. 2014

[20]海南五指山猪TLR2基因克隆及生物信息学分析. 张艳,黄丽丽,刘海隆,林哲敏,谭树义. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序