郏县红牛和安格斯牛18月龄背最长肌差异表达基因的筛选与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张格阳

作者： 张格阳;李玉龙;朱肖亭;张志杰;翟亚莹;牛欣然;黄永震;曾滔;张子敬;施巧婷;王二耀;吕世杰

作者机构：

关键词： 郏县红牛;安格斯牛;转录组;肌肉;候选基因

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2023 年 55 卷 005 期

页码： 14-20

收录情况： 北大核心

摘要： 旨在通过转录组学分析筛选出影响牛肌肉发育的候选基因.对5头18月龄的郏县红牛背最长肌进行转录组测序,获得转录组数据后与3头18月龄安格斯牛背最长肌的转录组数据(GSE57327)进行联合分析.结果:与安格斯牛相比,郏县红牛背最长肌中4 945个基因表达显著上调(FDR<0.05),2 186个基因显著下调(FDR<0.05).GO功能富集分析显示差异基因主要富集在与代谢相关生物学过程中.KEGG信号通路分析显示差异表达的基因主要富集到氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)等通路上.从氧化磷酸化通路中筛选出两品种间差异表达最显著的20个基因,通过反刍动物基因组数据库(ruminant genome database,RGD)查看该20个基因的组织表达情况,其中泛素-细胞色素c还原酶复合物Ⅲ亚基Ⅺ(UQCR11)、细胞色素c氧化酶亚基7A1(COX7A1)、细胞色素c铜伴侣蛋白(COX17)、NADH氢酶辅酶Q铁硫蛋白5(NDUFS5)和线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP5F1E)这5个基因在牛骨骼肌组织中的表达量高于其他组织,推测这5个基因在牛的生长发育过程中可能发挥重要作用,可作为候选基因进行进一步验证.

分类号： S823

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