藜麦SPP基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈紫岩

作者： 陈紫岩;林参;尹航;张豪杰;魏真真;余希文;吴传万;李茹

作者机构：

关键词： 磷酸蔗糖磷酸酶（SPP）;基因家族;藜麦;表达分析

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2022 年 010 期

页码： 116-123

摘要： 为明确CqSPPs基因家族的进化关系，以公开的藜麦基因组数据库为基础，鉴定出4个CqSPP基因，并进一步明确了各成员结构及其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、保守结构域、模体和启动子。以现有高通量转录组数据为基础，明确了各成员在藜麦不同组织中的表达水平，并采用qRT-PCR对各成员在苗期不同逆境下的表达水平进行了检测。CqSPPs分布于4个不同的染色体上，将其命名为CqSPP1～CqSPP4，其蛋白氨基酸数目在399～623之间，分子量介于45.24～70.77 kDa之间，理论等电点在5.64～6.93之间，同时表现出明显的亲水性。亚细胞定位预测显示除了藜麦SPP2蛋白预测结果为不确定外，其余蛋白主要定位在叶绿体上。蛋白保守模体分析结果显示，在该基因家族编码蛋白中预测得到10种保守模体，其中所有蛋白均含有8个排列顺序相同的模体。系统发育分析显示，植物中SPP基因家族可以分为5个组，其中CqSPP基因处于其中的2个组，并且与拟南芥SPP基因亲缘关系最近。启动子分析显示，各成员在启动子区域存在多种响应非生物胁迫的顺式转录元件。表达分析显示CqSPP1在各组织中均明显表达，而CqSPP4在各组织中表达量较低。在受到不同胁迫时，SPP基因家族的响应情况各不相同。结果表明CqSPPs有4个成员，且受多种非生物胁迫诱导表达，推测其可能在藜麦响应非生物胁迫过程中发挥了重要作用。

分类号： S519

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