基于DNA条形码基因和核基因的美丽小条鳅隐存多样性研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 高尚
作者: 高尚;向登高;李跃飞;李捷;陈蔚涛
作者机构:
关键词: 美丽小条鳅(Micronemacheilus pulcher);DNA条形码;COI;Glyt;隐存种
期刊名称: 淡水渔业
ISSN: 1000-6907
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 3-11
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为揭示华南地区美丽小条鳅(Micronemacheilus pulcher)的隐存多样性及其地理分布格局,同时为美丽小条鳅的精准管理和保护提供重要理论背景知识,本研究采集了华南地区多个水系19个地理群体共计102尾美丽小条鳅样本,测定了所有样本的DNA条形码标准基因(线粒体COI基因)与部分样本的糖基转移酶基因(Glyt基因),综合了系统发育分析、遗传距离估算、等位基因网状图分析、物种有效性界定等方法,基于COI基因的系统发育结果显示,美丽小条鳅存在两个主要谱系(I和Ⅱ),谱系Ⅰ主要由珠江水系、漠阳江水系、南流江水系群体构成,谱系Ⅱ由海南岛的陵水河水系和南渡江水系群体组成。另外,研究发现谱系Ⅰ可以细分为三个严格地理分布的子谱系(Ⅰ-1,Ⅰ-2和Ⅰ-3),其中子谱系Ⅰ-1由珠江水系的西江、北江和南流江水系的群体组成,子谱系Ⅰ-2和Ⅰ-3分别由珠江水系的东江群体和漠阳江水系群体组成;谱系Ⅱ可以分为子谱系Ⅱ-1和Ⅱ-2,分别由陵水河水系群体和南渡江水系群体组成。遗传距离估算发现谱系Ⅰ和Ⅱ之间的遗传距离达到5.83%,谱系Ⅱ的两个子谱系之间的遗传距离到达2.92%,大于2%的DNA条形码物种鉴定阈值。基于Glyt基因的系统发育分析未获得严格的谱系分化,但是等位基因网状图支持大陆群体和海南岛群体以及海南岛的陵水河水系群体和南渡江水系群体的进化独立性。基于COI基因的ABGD(automatic barcode gap discovery)和PTP(poisson tree process)分析和联合两个基因的BPP(bayesian phylogenetics and phylogeography)分析均支持谱系Ⅰ、子谱系Ⅱ-1和子谱系Ⅱ-2为三个独立物种,表明美丽小条鳅至少包含三个隐存种。研究结果表明美丽小条鳅的多样性可能被低估,亟需使用形态度量学、更高覆盖度的和多种类型的分子标记来全面系统揭示其隐藏的遗传多样性,为美丽小条鳅全面精准的管理保护提供数据支持。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]中国明亮熊蜂复合种的分子鉴定及分布特性. 刘苹,黄家兴,安建东,和绍禹,吴杰. 2014
[2]南极鱼类DNA条形码及分子系统进化研究. 赵娜,马春艳,宋炜,冯春雷,王鲁民,张凤英,蒋科技,赵宪勇,马凌波. 2018
[3]DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究. 张驰,刘海平,马波,王万良,曾本和,牟振波. 2019
[4]DNA条形码技术在黑龙江地区姬小蜂科物种鉴定中的应用与分析. 邵天玉,刘思竹,谢维欣,刘兴龙,李志勇,王克勤,朱朝东,刘丹. 2023
[5]信阳地区5种叶蝉的种类鉴定及亲缘关系分析. 乔利,秦道正,张丽,李伯辽,夏明聪,李慧龙,卢兆成. 2015
[6]梨形虫及其宿主硬蜱的协同进化分析. 苟惠天,关贵全,刘爱红,刘志杰,李有全,任巧云,陈泽,杨吉飞,殷宏,罗建勋. 2013
[7]mtDNA COI和ND5基因用于鉴别常见嗜尸性蝇类. 姜建军,王江峰. 2012
[8]4种河蓝蛤线粒体COI和16S rRNA基因序列的种间遗传分析. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2014
[9]我国不同地理群体栉江珧遗传多样性及系统发生分析. 严加坤,杨爱国,周丽青,吴彪,白临建,刘志鸿. 2013
[10]烟粉虱不同地理种群的mtDNACOI基因序列分析及其系统发育. 褚栋,张友军,丛斌,徐宝云,吴青君,朱国仁. 2005
[11]中国文昌鱼系统分类的线粒体COI和Cyt b基因片段分析(英文). 罗家聪,肖永双,宋林,高天翔,张岩. 2007
[12]河北省8种熊蜂mtDNACOI基因序列分析及其系统发育. 黄家兴,吴杰,安建东,国占宝,李继莲,童越敏. 2006
[13]多头带绦虫甘肃分离株分子COⅠ基因部分序列比较分析. 李文卉,盖文燕,姚菊霞,曲自刚,贾万忠,罗建勋,R.Blaga,付宝权. 2010
[14]东黄海沙海蜇群体线粒体COI基因序列多态性. 刘敏,程家骅,马凌波,凌建忠,李建生. 2010
[15]短吻红舌鳎鱼卵、仔鱼的DNA条形码和形态学鉴定. 周晓梦,郭书新,宋娜,张秀梅. 2017
[16]太平洋牡蛎核糖体DNA转录间隔子和线粒体基因片段序列测定(英文). 孔晓瑜,张留所,喻子牛,刘亚军,王清印. 2002
[17]蛱蝶科亚科间的分歧时间估计. 张敏,曹天文,金科,任竹梅,郭亚平. 2008
[18]基于线粒体COI和16S rRNA基因研究3个地理群体黑龙江河蓝蛤的遗传多样性. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2015
[19]烟粉虱不同地理种群的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育. 褚栋,张友军,丛斌,徐宝云,吴青君,朱国仁. 2005
[20]光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性研究. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2013
作者其他论文 更多>>
-
珠江中下游广东鲂种群结构及生长的空间差异
作者:朱书礼;李新辉;李跃飞;刘亚秋;武智;夏雨果;李捷
关键词:广东鲂;生长特征;种群结构;空间差异;珠江;十年禁渔;种质资源保护;渔业资源评估
-
华南地区大刺鳅的遗传结构与群体动态历史研究
作者:高尚;李跃飞;李捷;陈蔚涛
关键词:大刺鳅;遗传结构;遗传分化;种群动态历史
-
鲴亚科分子系统学研究
作者:李琳;陈蔚涛;汤永涛;周传江;何舜平;冯晨光
关键词:系统发育;多序列分析;分化时间估算;鲴亚科
-
不同熟期玉米品种籽粒田间脱水特征差异性分析
作者:李璐璐;明博;高尚;谢瑞芝;王克如;侯鹏;薛军;李少昆
关键词:玉米;生育期;籽粒;含水率;脱水速率
-
柳江鱼类群落结构及多样性研究
作者:朱书礼;陈蔚涛;李新辉;李捷;李跃飞
关键词:柳江;鱼类组成;物种多样性;空间分布;环境因子
-
越南与中国华南地区鲫(Carassius auratus)的遗传分化
作者:程磊;陈蔚涛;于晓丽
关键词:鲫;细胞色素b基因;遗传分化;谱系地理
-
玉米籽粒乳线比例变化与灌浆和干燥过程的关系
作者:李红燕;周林立;高尚;薛军;明博;赵如浪;王克如;谢瑞芝;侯鹏;王永宏;李少昆
关键词:玉米;乳线比例;籽粒干燥;灌浆动态