大白菜LACS家族基因鉴定与表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王荣花

作者: 王荣花;王树彬;刘栓桃;张志刚;李巧云;王立华;赵智中

作者机构:

关键词: 大白菜;LACS家族;蜡质;生物信息学分析;基因表达

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2022 年 54 卷 006 期

页码: 1-9

收录情况: 北大核心

摘要: 长链脂酰辅酶A合成酶(LACS)能催化游离的脂肪酸形成酰基辅酶A,是脂肪酸激活、转运、氧化及储存脂合成等生化途径的关键酶,在许多生物过程中发挥重要作用.本研究利用生物信息学方法鉴定大白菜LACS家族基因成员,分析其亲缘关系、蛋白质理化性质、染色体定位、共线性关系、基因结构、蛋白保守结构域和基因表达模式.结果表明,从大白菜全基因组共鉴定到13个BrLACS基因成员,分成4组,不均匀地分布在7条染色体和1个Scaffold上.BrLACSs的蛋白长度和分子量分别为199~1072 aa和23.10~121.10 kDa.与拟南芥AtLACS1、AtLACS5和AtLACS6共线性的BrLACS基因发生了扩张,出现了双拷贝(BrLACS5a、BrLACS5b和BrLACS6a、BrLACS6b)及三拷贝(BrLACS1a、BrLACS1b和BrLACS1c).表达模式分析表明,BrLACS4和BrLACS8基因在大白菜不同器官/组织中表达量最高,尤其在控制花器官蜡质性状中起着重要作用,在有蜡粉大白菜中的表达量显著高于无蜡粉大白菜.本研究结果为解析大白菜LACS基因在控制大白菜蜡质性状中的分子机制和指导大白菜亮绿种质资源创新具有重要意义.

分类号: S634.1:Q786

  • 相关文献

[1]大白菜KCS基因家族鉴定及在蜡粉近等基因系中表达分析. 王荣花,王树彬,张志刚,赵智中,李巧云,王立华,刘栓桃. 2022

[2]两个大白菜FT基因的生物信息学解析. 李利斌,刘立锋,李化银,程玉正,高建伟. 2010

[3]大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析. 宋晴晴,张慧敏,张烨,张一卉,李景娟,李化银,贺立龙,王凤德,高建伟. 2020

[4]辣椒组蛋白去乙酰化基因家族分离鉴定及表达分析. 李涛,徐小万,黎振兴,王恒明,李植良,李颖. 2015

[5]‘富士’苹果Ca~(2+)/H~+反向转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 程玉豆,冯云霄,关军锋. 2015

[6]向日葵查尔酮合酶HaCHS基因的克隆与逆境应答. 马立功,张匀华,孟庆林,石凤梅,刘佳,李易初,王志英. 2016

[7]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[8]玉米蔗糖转运蛋白基因ZmSUT4克隆及其低温胁迫下的表达模式. 弓雪,姜敏,齐欣,刘欣芳,卢生乔,陈坤,刘亚利,张述宽,马涛,杨耀迥. 2019

[9]橡胶树果糖-1,6-双磷酸酯酶基因的克隆及表达特性分析. 龙翔宇,曹冰,梁启福,方永军,戚继艳. 2013

[10]小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析. 孙丽静,赵慧,吕亮杰,张颖君,胡梦芸,刘茜,李辉. 2019

[11]甘蔗ScHAK9基因克隆及表达分析. 罗海斌,黄诚梅,蒋胜理,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018

[12]甘蔗ScHAK10基因克隆及表达分析. 罗海斌,蒋胜理,黄诚梅,曹辉庆,邓智年,吴凯朝,徐林,陆珍,魏源文. 2018

[13]糜子抗白粉病基因(Mlo)编码蛋白的序列特征及表达分析. 石甜甜,何杰丽,秦明月,陈凌,王海岗,王瑞云,乔治军. 2018

[14]ghr-miR160负调控棉花叶片衰老机理研究. 段珊,喻树迅,窦玲玲,程帅帅,郭亚宁,庞朝友,马启峰,魏恒玲,范术丽,王寒涛. 2018

[15]水稻GATA基因家族生物信息学分析. 骆鹰,王有成,王伟平,张超. 2018

[16]水稻WOX家族基因鉴定及其种子在逆境萌发中的表达分析. 张琪,张爱霞,贾俊婷,赵华,刘军,陈兵先. 2022

[17]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023

[18]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[19]甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析. 周媛媛,赵春玲,侯夫云,李爱贤,秦桢,王庆美,董顺旭. 2023

[20]桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析. 李云琴,王毅,张子蕴,原晓龙,杨焱,杨文忠. 2021

作者其他论文 更多>>