基于全基因组填充重测序关联分析鉴别影响苏山猪初生体尺与乳头数性状的遗传位点

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张昌政

作者： 张昌政;李德森;黄敏;方晓敏;赵为民;任守文;董焕声;任军;周李生

作者机构：

关键词： 苏山猪;初生体尺;乳头数;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 88-102

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在鉴别影响苏山猪初生体尺和乳头数性状的遗传位点，开发可用于辅助育种的分子标记，为苏山猪生长和繁殖性能的持续选育提供理论基础。本试验对269头苏山猪初生仔猪（出生后24 h内）的体尺和乳头数表型进行测定，并采集耳组织样品。基于全基因组重测序及基因型填充策略，利用全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）和群体分化指数（fixation index,Fst）的方法挖掘与目的性状强关联位点，并对位置功能候选基因开展GO和KEGG分析，确定最有可能的主效基因。本研究共鉴别到4个候选位点，分布在13、14和X染色体上，其中与初生体尺性状显著关联的位点有2个，与乳头数性状显著关联的位点有2个。本研究筛选出1个与体长性状相关的候选基因ACTA2;1个与胸围性状相关的候选基因COL4A6;3个与乳头数性状相关的候选基因ACTA2、CRTAP和SEPTIN6,为苏山猪初生体尺性状和乳头数性状的遗传改良提供了重要的分子标记。

分类号： S828.2

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