2016-2020年浙江地区猪圆环病毒2型分子流行病学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 徐丽华

作者: 徐丽华;苏菲;李军星;余斌;叶十一;杨富文;邓利荣;毛慧敏;袁秀芳

作者机构:

关键词: 猪圆环病毒2型;全基因组;Cap蛋白;分子流行病学;遗传变异

期刊名称: 浙江大学学报(农业与生命科学版)

ISSN:

年卷期: 2022 年 005 期

页码:

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)在浙江地区的流行病学特点和遗传变异规律,本研究采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对2016—2020年采自浙江省不同地区猪场的1 725份疑似猪圆环病毒2型感染的临床病料进行PCV2的病原学检测,同时对部分阳性样品进行全基因组扩增、克隆和测序,并与Gen Bank中收录的16株参考株序列进行比对和遗传进化分析。结果表明:PCV2检测阳性的样品有359份,平均阳性率为20.8%,2016—2020年PCV2阳性率分别为38.1%、23.2%、24.1%、12.5%和10.7%;测序所得PCV2 36个全基因序列的核苷酸同源性为94.0%~99.9%,与国产疫苗株核苷酸同源性为94.7%~98.5%,与参考株核苷酸同源性为92.9%~99.8%;遗传进化分析显示PCV2 36个全基因序列可分为3个基因型,其中11株为PCV2a型,8株为PCV2b型,17株为PCV2d型,PCV2d为优势基因型;ORF2基因全长分别为705 bp(16株)和702 bp(20株),相互间核苷酸同源性为88.7%~100.0%,与国产疫苗株核苷酸同源性为90.2%~99.6%,与参考株核苷酸同源性为85.0%~100.0%。Cap蛋白的氨基酸序列分析表明,36株序列除了唯一糖基化位点呈高度保守外,存在较多的点突变,且不同基因型具有其代表性突变位点,优势基因型PCV2d的特异性突变位点主要集中在I53、N68、L89、T121、R168、I215。本研究为浙江地区PCV2的免疫预防提供了参考,为新型疫苗的研制积累了有效材料。

分类号: S852.651

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