基于元分析和生物信息学分析的玉米抗旱相关性状QTL一致性区间定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 栗文娟

作者： 栗文娟;刘志斋;石云素;宋燕春;王天宇;徐辰武;黎裕

作者机构：

关键词： 玉米;抗旱性;“一致性”QTL;元分析;生物信息学方法

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 09 期

页码： 1457-1467

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 定位玉米基因组中一致的抗旱性区段是玉米抗旱分子育种的重要基础。本研究对至今发表的在干旱条件下定位的相关性状QTL信息搜集整理,以IBM2 2008 Neighbors为参考图谱,利用overview分析和元分析方法进行Meta-QTL(MQTL)检测,共发掘79个MQTL,生物信息学分析结果显示,有43个区间内包含抗旱相关基因信息,占检出MQTL总数的54.43%。基于MaizeGDB网站的Genome Browser中的遗传图谱与物理图谱的整合信息,进行MQTL物理距离的估算,根据maizesequence网站的玉米基因组序列信息,进行初步的抗旱基因预测表明,这些区段中包含丰富的MYB、bZIP以及DREB转录因子序列信息以及大量的LEA基因家族成员。

分类号： S513

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