感染"褐色沉积症"虾夷扇贝的外套膜转录组测序及差异表达基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于佐安

作者： 于佐安;李大成;李华琳;刘项峰;滕炜鸣;刘忠颖;王庆志;周遵春

作者机构：

关键词： 虾夷扇贝;褐色沉积症;转录组;关键基因

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 284-296

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为分析“褐色沉积症”形成分子机制,探究筏式养殖虾夷扇贝（Mizuhopecten yessoensis）贝壳内侧褐色沉积症状形成原因,采用Illumina高通量测序平台对感染“褐色沉积症”虾夷扇贝和健康虾夷扇贝外套膜组织进行转录组测序分析。结果显示,患病和健康扇贝外套膜分别获得43862251和41806737条clean reads。经参考基因组比对分析,患病和健康扇贝外套膜表达基因数量分别为17835个和16816个,差异表达基因208个,其中上调基因170个,下调基因38个。选取6个差异表达基因进行荧光定量PCR （q RT-PCR）验证,结果证明转录组测序分析可靠。GO功能富集发现差异基因主要富集在几丁质代谢、含氨基葡萄糖化合物代谢、几丁质结合和氨基糖代谢等与几丁质合成代谢相关的通路;KEGG通路富集分析发现差异基因主要参与内质网蛋白质合成、内吞作用、剪接体和谷胱甘肽代谢等途径;对差异表达倍数显著的前40个基因分析发现,编码类咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶（caffeoyl-Co A O-methyltransferase-like,CCOAOMT-L）、类1-氨基环丙烷-1羧酸合酶（1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthaselike protein,ACCS-L）、黄蛋白（protein yellow-like）、热休克蛋白70 （HSP70）、过氧化物酶成熟因子（DUOXA1）、多烯脂肪酸异构酶（poly enoic fatty acid isomerase,PFI）、Na+/Cl+依赖的甘氨酸转运蛋白（sodium-and chloride-dependent glycine transporter,Gly T1）、类酪氨酸酶（putative tyrosinase-like protein,Putative Tyr-3）、Toll样受体（protein toll）等与蛋白质醌鞣化、免疫、氧化、神经传递相关的基因与褐色沉积症形成密切相关,揭示了虾夷扇贝外套膜褐色沉积症形成的内在原因。

分类号： S944.43

  • 相关文献

[1]筏式养殖虾夷扇贝"褐色沉积症"形成原因初步研究. 于佐安,李大成,王庆志,李华琳,于笛,刘项峰,滕炜鸣,王笑月,周遵春. 2022

[2]黄秋葵果实质地变化的生化和转录组联合分析. 张国芹,牟建梅,陈虎根. 2023

[3]梅和杏果实有机酸代谢差异研究. 翁金洋,薛松,倪照君,阎依超,沈志军,高志红. 2018

[4]梅和杏果实有机酸代谢差异研究. 翁金洋,薛松,倪照君,阎依超,沈志军,高志红. 2018

[5]作物驯化和品种改良所选择的关键基因及其特点. 张学勇,马琳,郑军. 2017

[6]作物驯化和品种改良所选择的关键基因及其特点. 张学勇,马琳,郑军. 2016

[7]红掌佛焰苞数字基因表达谱及关键基因表达水平分析. 彭佳佳,刘克林,刘丽娅,吕学华,杨哲,李佩愉,刘春,明军,袁素霞,平吉成,张黎. 2016

[8]植物黄酮醇生物合成关键基因研究进展. 方芳,王凤忠. 2018

[9]玫瑰挥发性香气成分研究进展. 赵艳侠,赵玉龙,张晶莹,刘艳,孙骏飞,李益. 2023

[10]利用加权基因共表达网络分析方法挖掘香菇发育不同阶段的关键基因. 宋婷婷,沈颖越,徐飞,范丽军,蔡为明. 2021

[11]昆虫性别决定级联的研究进展. 刘雅婷,王文璐,陈宗泽,谢文,张友军. 2023

[12]虾夷扇贝的多态性微卫星座位. 赵莹莹,朱晓琛,孙效文,梁利群,孙洋,刘丹. 2006

[13]虾夷扇贝的摄食生理研究. 徐东,张继红,王文琪,董美涛,王忠. 2010

[14]虾夷扇贝对牙鲆的粪便、残饵及网箱养殖区沉积物的摄食. 张继红,吴桃,徐东,高亚平,唐望. 2013

[15]两种壳色虾夷扇贝的RAPD分析. 孙秀俊,杨爱国,刘志鸿,周丽青. 2009

[16]两种壳色虾夷扇贝的同工酶分析. 孙秀俊,杨爱国,刘志鸿,周丽青,王卫军. 2009

[17]基于遗传连锁图谱筛选虾夷扇贝性别相关AFLP分子标记的方法. 周丽青,杨爱国,刘志鸿,王清印,吴彪,孙秀俊,郑利兵,郑言鑫. 2014

[18]栉孔扇贝♀×虾夷扇贝♂单对杂交子一代的ISSR分析. 何斌,杨爱国,王清印,刘志鸿,周丽青. 2007

[19]虾夷扇贝×栉孔扇贝人工受精过程的荧光显微观察. 杨爱国,王清印,刘志鸿,张岩. 2002

[20]栉孔扇贝♀×虾夷扇贝♂杂交子一代与其双亲同工酶的比较研究. 何斌,杨爱国,王清印,刘志鸿,周丽青. 2006

作者其他论文 更多>>

微信小程序