花生SSR核心引物筛选及育成品种DNA指纹图谱构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 任小平

作者： 任小平;郑艳丽;黄莉;陈玉宁;周小静;陈伟刚;雷永;晏立英;万丽云;廖伯寿;姜慧芳

作者机构：

关键词： 花生;SSR荧光标记;毛细管电泳技术;指纹图谱

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2016 年 38 卷 05 期

页码： 563-571

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据SSR引物在遗传连锁图上的位置,首先选择200对均匀分布在染色体上,且通过聚丙烯酰胺凝胶电泳银染技术筛选表现为条带清晰、可重复的单位点引物,再利用毛细管电泳技术筛选等位变异数≥4个、引物的PIC值≥0.4、杂合度≤0.1的引物,并参考其所在染色体位置,获得60对具有丰富的多态性、广泛的代表性、均匀分布的SSR引物,同时普通引物和荧光引物都具有较好的扩增效果,作为花生品种构建指纹图谱的核心引物。60对SSR引物在100份材料中共扩增出352个多态性等位位点,引物扩增的等位位点均值为5.87;每对引物可区分的基因型数目均值是6.35;引物的多态性信息指数(PIC值)均值是0.54。高多态性的SSR引物占66.67%,SSR引物杂合度都在0.06以下。品种间的遗传相似系数变幅为0.530~0.683。构建了100份花生的指纹图谱,每一条指纹都具有唯一性,可标识一个品种,为全国花生品种及资源的DNA指纹数据库的构建奠定基础。

分类号： S565.2

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