谷胱甘肽促进牛体外受精胚胎发育的转录组初探

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于学颖

作者： 于学颖;郭芹芹;郝海生;孙尉峻;赵学明;朱化彬;杨凌;杜卫华

作者机构：

关键词： 牛体外胚胎;转录组测序;定量PCR;新转录本;功能注释;代谢通路

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2016 年 47 卷 07 期

页码： 1363-1372

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在探究牛体外受精胚胎的培养液中添加3mmol·L~(-1)谷胱甘肽(Glutathione,GSH)后,8~16-细胞期和桑椹期的牛体外胚胎在转录组水平上的变化。收集8~16-细胞期和桑椹期的体外受精胚胎,构建文库,通过Illumina平台进行测序;筛选差异基因,并进行功能注释和代谢途径分析;采用定量PCR对10个基因的表达水平进行检测,以验证测序结果的准确性;在获得的新转录本中挑选3组进行RNA和蛋白结构的预测。通过OOSP1、THAP9等10个基因的定量检测、测序结果的质量评价(碱基错误率、Q20、Q30、GC含量)、reads与牛基因组的比对及其在基因组的分布统计分析,均说明该测序结果准确、可靠。测序获得差异表达基因4 100个(其中,处理组8~16-细胞期胚胎和桑椹胚中3 952个,对照组中884个),已知基因2 225个,未知基因1 875个。这些差异基因主要富集到与ATP合成、呼吸链、DNA合成、翻译过程和物质代谢相关的84条GO terms上,参与细胞黏附、柠檬酸循环、谷胱甘肽代谢、溶酶体以及氨基酸代谢等27条通路。另外,与已知的转录本相比,5个新转录本中均发现不同长度的新外显子;预测的蛋白结构中除包含各自的保守结构域(丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的催化结构域、MAD同源结构域)外,还发现2个新的蛋白结构域(低复杂区、dwarfins蛋白家族B结构域)。综上表明,在培养液中添加GSH能导致胚胎转录谱的变化,显著提高胚胎的体外发育能力。

分类号： S823

  • 相关文献

[1]米蛾嗅觉基因的转录组分析. 李鹏燕,张秋婷,黄铮昱,黄华,陈伟平,廖永林. 2021

[2]基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜新转录本的鉴定. 徐文,安素妨,王艳,贾琳琳,鲁丹丹,张莹莹,刘建丰,李保全. 2018

[3]NaCl胁迫下黑果枸杞转录组测序分析. 马彦军,段慧荣,魏佳,Richard John Tiika,单立山,马瑞. 2020

[4]基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选. 赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧. 2019

[5]基于转录组测序的油棕脂肪酸合成基因的筛选及分析. 周丽霞,吴翼,张安妮,杨耀东. 2023

[6]禽白血病病毒感染鸡肝脏的转录组变化与新基因分析. 李国辉,韩威,张会永,王洪志,殷建玫,苏一军. 2016

[7]大豆抗胞囊线虫4号小种转录组测序及分析. 吴书峰,王志,乔治军,张瑞军,张海平. 2016

[8]基于转录组测序的紫背天葵花青素相关基因分析. 张少平,张少华,邱珊莲,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌,郑加协. 2018

[9]斜纹夜蛾四龄幼虫暴食相关基因的鉴定和通路分析. 张赞,彭莉舒,李坤,钱坤,相栋,何林. 2021

[10]利用RNA-seq技术筛选药用野生稻抗白叶枯病相关基因. 杨雅云,张斐斐,张发美,阿新祥,董超,汤翠凤,杨春云,戴陆园. 2024

[11]红松雌球花原基分化的转录组分析. 孙佳彤,杨会侠,李虹谕,高源,李连强,任如月,于璐. 2025

[12]120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析. 顾丽红,李金明,张细权,邱峰芳,邢增杨,林哲敏. 2019

[13]不同冷冻方法对牛体外胚胎ATP含量与ROS水平的影响. 赵学明,杜卫华,王栋,郝海生,朱化彬. 2012

[14]180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析. 顾丽红,刘志勇,张细权,邱峰芳,邢增杨,赵建国,林哲敏. 2019

[15]添加胰岛素-转铁蛋白-亚硒酸钠对牛体外胚胎生产、低温保存及常规冷冻效果的影响. 张浩波,赵善江,王欢,徐茜,冯志强,王婉洁,巩建飞,庞云渭,杜卫华,朱化彬. 2023

[16]基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究. 张雅玲,王小安,潘少霖,叶新福. 2017

[17]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 2018

[18]基于转录组测序的紫色秋葵花青素合成相关基因研究. 张少平,应璐,邱珊莲,张帅,洪建基,郑开斌,余文权. 2018

[19]溪黄草转录组测序及生物信息学分析. 王继华,蔡时可,梅瑜,李汉章,杨少海. 2020

[20]8个番石榴品种的转录组测序. 张丽梅,陈钟佃,张朝坤,魏秀清,许家辉. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序