普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李园

作者: 李园;常玉洁;王兰芬;王述民;武晶

作者机构:

关键词: 普通菜豆;镰孢菌枯萎病;全基因组关联分析;抗性基因/种质资源

期刊名称: 植物学报

ISSN: 1674-3466

年卷期: 2023 年 001 期

页码: 51-61

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 普通菜豆镰孢菌枯萎病是严重制约菜豆(Phaseolus vulgaris)产量的主要病害之一。采用下胚轴双孔注射法对601份普通菜豆种质资源进行枯萎病抗性鉴定,共筛选出4份高抗材料。在此基础上,基于分布在全基因组上的3 765 456个单核苷酸多态性(SNP)标记,进行全基因组关联分析,以P<1×10–5为阈值。结果检测到57个显著关联的SNP位点,分布于1、2、6、8和11号染色体上;共获得8个显著关联区域,其中位于1号染色体上的区域1包含SNP最多(48个),最显著SNP P值为2.18E–07。在8个显著关联区域中,共检测到186个基因,其中157个基因有注释信息,编码过氧化物酶、抗病蛋白、转录因子和蛋白激酶等。结合KEGG富集分析和序列同源性比对,鉴定出9个候选基因可能与抗性相关。

分类号: S436.43

  • 相关文献

[1]水杨酸诱导普通菜豆镰孢菌枯萎病抗病性的研究. 薛仁风,武晶,朱振东,王兰芬,王晓鸣,葛维德,王述民. 2014

[2]应用荧光定量PCR技术分析普通菜豆品种中尖镰孢菜豆专化型定殖量. 薛仁风,朱振东,黄燕,王晓鸣,王兰芬,王述民. 2012

[3]应用cDNA-AFLP技术分析普通菜豆镰孢菌枯萎病抗病相关基因的表达. 薛仁风,朱振东,王晓鸣,武小菲,王述民. 2011

[4]普通菜豆镰孢菌枯萎病抗病相关基因PvCaM1的克隆及表达. 薛仁风,朱振东,王晓鸣,王兰芬,武小菲,王述民. 2012

[5]普通菜豆生长素调节蛋白基因PvARP1的克隆及表达分析. 薛仁风,丰明,赵阳,陈剑,李韬,葛维德. 2019

[6]普通菜豆中烟草水杨酸结合蛋白2同源基因的鉴定及表达特征分析. 薛仁风,王利,丰明,葛维德. 2018

[7]PvEG261对普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性和抗旱性的影响. 薛仁风,丰明,黄宇宁,Matthew BLAIR,Walter MESSIER,葛维德. 2021

[8]普通菜豆抗菜豆象性状的全基因组关联分析. 李晓明,王兰芬,唐永生,常玉洁,张菊香,王述民,武晶. 2023

[9]普通菜豆种质资源研究现状及进展(英文). 李斌,陈树良,秦超,肖靖. 2016

[10]普通菜豆种质资源研究现状及进展. 肖靖,李斌,石晓华,鄂成林,管洪波,凤桐. 2016

[11]普通菜豆PvP5CS2基因对逆境胁迫的应答. 陈吉宝,景蕊莲,毛新国,昌小平,王述民. 2008

[12]普通菜豆抗旱生理特性. 李龙,王兰芬,武晶,景蕊莲,王述民. 2014

[13]菜豆种质抗普通细菌性疫病鉴定评价. 徐新新,王晓鸣,朱振东,王述民. 2011

[14]普通菜豆品种苗期抗旱性鉴定. 李龙,王兰芬,武晶,景蕊莲,王述民. 2015

[15]普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析. 陈明丽,王兰芬,武晶,张晓艳,杨广东,王述民. 2014

[16]普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析. 陈明丽,王兰芬,武晶,张晓艳,杨广东,王述民. 2014

[17]普通菜豆抗炭疽病基因SCAR标记鉴定. 赵晓彦,王晓鸣,王述民. 2007

[18]普通菜豆优异种质联合鉴定研究. 王述民,张亚芝,王石宝,刘绍文,李家银. 1996

[19]以SSR标记对普通菜豆抗炭疽病基因定位. 王坤,王晓鸣,朱振东,赵晓彦,张晓艳,王述民. 2009

[20]利用SSR标记评价普通菜豆种质遗传多样性. 张赤红,王述民. 2005

作者其他论文 更多>>