基于基因组SNP信息分析新疆夏洛莱牛群体的遗传结构和遗传背景初报
文献类型: 中文期刊
第一作者: 蒋烈戈
作者: 蒋烈戈;彭健;代蓉;高攀;苏政;刘鹏;朱婷婷;钟发钢;赵博;蔡国宝
作者机构:
关键词: 新疆夏洛莱;基因组SNP信息;遗传多样性;遗传结构;近交系数
期刊名称: 草食家畜
ISSN: 1003-6377
年卷期: 2023 年 001 期
页码: 9-15
摘要: 近50年来,引入的夏洛莱牛在塔额盆地已初步形成遗传性能稳定、产肉性能好的新类群。然而,在夏洛莱牛的杂交改良和选育过程中,缺乏系统的育种档案资料,存在着群体遗传背景不清、血缘关系不明等问题。本研究利用基因组高通量检测技术,分析新疆夏洛莱杂交新类群核心群中的全基因组水平SNPs变化,样本SNP数据平均检出率(Call Rate值)大于90%(99.40%),检测后分析群体中有效群体含量(Ne)、群体的多态性标记比例(Pn),群体的期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)等数据,得出现有新疆夏洛莱核心群体的纯度较好,有效群体含量为28.69,个体间的亲缘关系呈中等程度、整个群体分为26个家系,个体基于ROH的近交系数值是0.030。结论:基因组分析运用高通量测序,通过关联分析,对新疆夏洛莱肉牛群体明确系谱信息,开展全基因组选育,指导组建核心育种群,为群体的遗传背景和血缘关系提供科学依据,对提高今后新疆夏洛莱群体选种的正确性,缩短世代间隔,建立现代新型良种繁育体系有重要的意义。
分类号: S823.2
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