利用微卫星遗传标记评估5个西藏牦牛群体遗传多样性及群体结构
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张强
作者: 张强;洛桑顿珠;巴桑旺堆;彭阳洋;俄广鑫;尼玛次仁;索朗多吉;巴多;旦巴;鲜莉莉;旦巴加参;支张;平措占堆
作者机构:
关键词: 西藏牦牛;微卫星标记;遗传多样性;群体结构
期刊名称: 中国畜牧兽医
ISSN: 1671-7236
年卷期: 2022 年 49 卷 006 期
页码: 2228-2238
收录情况: 北大核心
摘要: [目的]评估当前西藏主要牦牛群体遗传多样性,梳理不同地区群体间遗传结构,明确西藏5个牦牛群体(阿里牦牛、斯布牦牛、娘亚牦牛、类乌齐牦牛和帕里牦牛)的保种情况和种群间系统发育关系.[方法]利用13个微卫星标记(SSR)对5个牦牛群体共计195个个体进行基因分型,并对各群体的等位基因数量、基因杂合度、多态信息含量及群体间遗传距离等遗传参数进行评估.[结果]阿里牦牛群体等位基因数最多(6.43),类乌齐牦牛等位基因数最少(5.00);观测杂合度范围为0.5311(娘亚牦牛)~0.5995(类乌齐牦牛).各群体内偏离Hardy-Weinberg平衡的位点数为5(类乌齐牦牛)~9(阿里牦牛)个;群体内近交系数最高为0.172(阿里牦牛),且4个群体(阿里牦牛、娘亚牦牛、斯布牦牛和帕里牦牛)存在显著近交风险(P<0.05).从遗传结构来看,所有群体间均为显著遗传分歧(P<0.05),STRUCTURE分析结果显示,5个牦牛群体划分为3个簇,其中阿里牦牛较其他牦牛群体具有更为丰富的遗传背景.系统发育树结果表明,不同群体间系统发育关系相对独立,且与种群栖息地分布不一致.主坐标分析(PCoA)结果显示,不同群体间部分个体存在较近亲缘关系,表明不同群体间存在遗传物质交流.[结论]5个西藏牦牛群体具有丰富的遗传多样性水平,且种群系统发育关系相对独立,但多数群体存在群体事件风险.本研究不仅有助于明确西藏牦牛地方种群遗传多样性水平,同时可为今后的保种策略提升提供理论参考.
分类号: S813.3
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