水稻种质资源全基因组DNA指纹鉴定方法研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 马小定

作者: 马小定;崔迪;韩冰;焦成智;韩龙植

作者机构:

关键词: SNP标记;指纹图谱;遗传相似度;实质性派生品种

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN:

年卷期: 2023 年 004 期

页码: 1106-1113

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 开展水稻种质资源DNA指纹鉴定可以赋予每份种质统一的身份信息,对于查清我国资源家底、评估资源遗传基础、提高资源利用效率和保护种业知识产权等具有重要意义。本研究利用已完成全基因组DNA重测序的5374份水稻种质资源为材料,通过参考样本资源的选择、高质量SNP位点分析以及最优SNP数量和SNP组合的挑选,建立了2套水稻种质资源全基因组DNA指纹标准。通过主成分分析和系统进化树分析,指纹标准1和2选择的SNP可以代表94,197个高质量群体共有SNP进行群体遗传多样性检测;群体遗传相似度分析验证了指纹标准1和2对于开展水稻种质资源遗传相似性鉴定的有效性。本研究有望为水稻种质资源保护与利用以及种业知识产权保护等提供技术支撑,并为其他作物制定全基因组DNA指纹鉴定标准提供参考。

分类号: S511

  • 相关文献

[1]用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究. 侯莉娟,齐晓,齐冬梅,陈双燕,刘公社. 2016

[2]利用CottonSNP63K芯片构建棉花品种的指纹图谱. 孙正文,孙正文,匡猛,马峙英,王省芬. 2017

[3]甘蓝SNP标记开发及主要品种的DNA指纹图谱构建. 李志远,于海龙,方智远,杨丽梅,刘玉梅,庄木,吕红豪,张扬勇. 2018

[4]实质性派生品种鉴定方法研究进展. 褚云霞,陈海荣,邓姗,黄志城,李寿国. 2017

[5]我国建立实质性派生品种制度的必要性讨论. 陈红,刘平,吕波,张新明,饶智宏,郑金贵,宋敏. 2009

[6]种子企业如何做好植物新品种保护和创新. 郭建强,高雪飞,舍刚,高翔,蔺怀龙,陈微林,姜辉,权永刚,王爱华,梁晓玲. 2023

[7]5个罗非鱼群体的遗传分析与分子标记. 杜诚,卢迈新,叶星,劳海华,黄樟翰,白俊杰. 2005

[8]牙鲆连续两代减数分裂雌核发育家系的遗传特征. 王桂兴,刘海金,张晓彦,刘永新,王玉芬,蒋丽. 2012

[9]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 2015

[10]基于二代测序技术的MNP标记鉴别刺芹侧耳菌株. 魏传正,王朦,张鹏,刘芳,严俊杰,谢宝贵,邓优锦,谢路昱. 2023

[11]我国主推玉米品种亲本的遗传结构解析. 李晶晶,张文洋,王利锋,王浩,李会勇. 2021

[12]应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型. 赵均良,张少红,刘斌. 2011

[13]两种施肥环境下冬小麦京411及其衍生系产量和生理性状的遗传分析. 肖永贵,李思敏,李法计,张宏燕,陈新民,王德森,夏先春,何中虎. 2015

[14]基于SNP标记分析玉米品种吉单50的遗传基础. 路明,张志军,郑淑波,岳尧海,刘宏伟. 2016

[15]SNP标记技术及其在农作物育种中的应用. 李兆波,吴禹,王岩,汪由,王光霞. 2010

[16]利用高密度SNP标记定位水稻粒形相关QTL. 孙志忠,孙学武,谭炎宁,余东,刘瑞芬,袁贵龙,丁佳,袁定阳. 2015

[17]高粱单核苷酸多态性(SNP)标记开发研究初报. 籍贵苏,吕芃,杜瑞恒,刘国庆,侯升林,马雪,李素英,王金萍,赵秀萍. 2018

[18]利用全基因组SNP芯片分析油菜遗传距离与杂种优势的关系. 桑世飞,王会,梅德圣,刘佳,付丽,王军,汪文祥,胡琼. 2015

[19]SNP标记在小麦遗传育种中的应用研究进展. 许陶瑜,唐朝晖,王长彪,任永康,赵兴华,刘江,赵霞. 2017

[20]甘薯(Ipomoea batatas L.)SNP标记快速高效检测方法. 李强,后猛,刘亚菊,王欣. 2015

作者其他论文 更多>>