青海野生黄色类群羊肚菌群体遗传结构分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孟清
作者: 孟清;谢占玲;蒋宏忱;徐鸿雁;郭璟;李艳艳;王翠;虎智红;严尚金;刘惠琳
作者机构:
关键词: 羊肚菌;黄色类群;遗传多样性;遗传结构;生境破碎化
期刊名称: 菌物学报
ISSN:
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 1328-1342,370-372
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为明确青海野生黄色类群羊肚菌群体的遗传结构和遗传多样性,本研究利用SSR分子标记对来自青海省3个地理单元7个地区的35株野生黄色类群羊肚菌进行分析。结果显示,12对引物共扩增出54条清晰可识别条带,其中多态性条带有48条,占比88.8%。居群水平的Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s多样性指数分别为0.3716–0.6051、0.6533–0.8436,青海7个野生黄色类群羊肚菌遗传多样性较丰富。居群间的遗传分化系数和基因流值平均为0.059、0.137,青海野生黄色类群羊肚菌栖息地生境碎片化严重。UPGMA聚类的遗传相似系数在0.49–0.85之间,相似系数0.526水平下可将35个菌株划分为3个支系,与PCoA主成分分析、Mantel检验结果和STRUCTURE聚类结果基本一致,存在着南北和东西隔离模式。阿尼玛卿山为南北隔离模式,隔离了青南地区与青北(海东,海北)地区基因交流;而达坂山为西北与东隔离模式,隔离了东(海东)与西北(海北)地区基因交流。STRUCTURE遗传结构推测青海野生黄色类群羊肚菌居群来自于3个祖先亚群,并且94%遗传变异由居群内造成。青海野生羊肚菌居群内基因型丰富,但遗传多样性水平低,栖息地生境破碎化严重。
分类号: S646.7
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