希尔斯山羊草1SsS和3SsS染色体特异dCAPS标记的建立
文献类型: 中文期刊
第一作者: 倪佳俊
作者: 倪佳俊;韩冉;徐文竞;王开;祁广;曾小雪;訾妍;李豪圣;刘建军;汪晓璐;刘成
作者机构:
关键词: 小麦;希尔斯山羊草;基因组重测序;SNP分析;dCAPS标记
期刊名称: 山东农业科学
ISSN:
年卷期: 2023 年 005 期
页码: 15-21
摘要: 希尔斯山羊草是小麦的近缘种,具有抗病、抗逆、抗虫等优异性状,是小麦遗传改良的珍贵基因源。当前,我们创制了一批小麦-希尔斯山羊草杂交种质。然而,由于缺乏分子标记,上述种质无法被有效筛选和鉴定。为了建立希尔斯山羊草染色体特异分子标记,本研究通过对希尔斯山羊草基因组重测序,发掘希尔斯山羊草和小麦间单核苷酸多态性(SNP),选择150个多态性位点开发dCAPS标记,结果发现,相比中国春等小麦对照,利用引物AESD23和AESD105经PCR和酶切电泳后分别能在希尔斯山羊草中获得长度不同的多态性条带。利用一套中国春-希尔斯山羊草二体附加系和端体附加系对这些多态性条带进行定位,结果发现,AESD23能在中国春-希尔斯山羊草1Ss二体附加系和1SsS端体附加系中扩增出长度为1 800 bp的多态性条带,而AESD105能在中国春-希尔斯山羊草3Ss二体附加系和3SsS端体附加系中扩增出长度为200 bp和300 bp的多态性条带。对小麦-希尔斯山羊草杂交种质检测发现,AESD23和AESD105均能对小麦-希尔斯山羊草杂交种质进行有效筛选和鉴定。因此,上述3个多态性片段可以作为dCAPS标记用于检测含希尔斯山羊草1SsS或3SsS染色质的材料,为检测和追踪小麦背景中希尔斯山羊草染色质提供了新的检测手段。
分类号: S512.1
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