绒山羊4个多胎性状候选基因多态性及其与产羔数的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 萨初拉

作者： 萨初拉;吴铁成;马跃军;何云梅;朱莉仙;何托雅;武玉平;刘斌

作者机构：

关键词： 绒山羊;GDF9基因;BMP15基因;BMPR1B基因;B4GALNT2基因;产羔数

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 1037-1047

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】通过对内蒙古白绒山羊4个多胎性状相关基因进行测序和生物信息学分析，深入挖掘与产羔数显著相关的单核苷酸多态位点（single nucleotide polymorphisms, SNP）位点，为提升绒山羊高效繁育提供理论依据。【方法】选取阿拉善型、阿尔巴斯型绒山羊母羊244只，利用MultipSeq多重PCR结合二代高通量技术检测生长分化因子9（growth differentiation factor 9,GDF9）、骨形态发生蛋白15 （bone morphogenetic protein 15,BMP15）、骨形态发生蛋白受体1B（bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B）和β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2 （beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 2,B4GALNT2）基因多态性，并对不同SNP位点与绒山羊产羔数进行关联分析。【结果】通过GATK分析共预测得到172个SNPs位点，其中BMPR1B、B4GALNT2、BMP15、GDF9基因相关SNPs位点分别为95、33、26和18个。GLM模型关联分析发现，10个SNPs位点与白绒山羊产羔数显著相关（P＜0.05）,进一步进行卡方检验发现，其中7个SNPs位点基因型与产羔数显著相关（P＜0.05）。BMPR1B基因g.29893723 C＞G、g.29897064 G＞A、g.29897722 G＞A、g.29897734 C＞A和g.29938673 C＞G位点的CC、GG、GA、CA和CC基因型个体产羔数分别显著高于CG、GA、GG、CC和GG基因型（P＜0.05）;B4GALNT2基因g.37072289 G＞A位点的GG和GA基因型个体产羔数均显著高于AA基因型（P＜0.05）;GDF9基因g.66027842 A＞C位点的CC和AC基因型个体产羔数均显著高于AA基因型（P＜0.05）。【结论】试验获得了内蒙古白绒山羊多胎性状相关基因GDF9、BMP15、BMPR1B和B4GALNT2的SNPs位点序列特征，发现了与白绒山羊产羔数显著相关的10个SNPs位点，并揭示了不同基因型产羔数间的差异，从而为内蒙古白绒山羊分子辅助育种提供了有力的SNP参考位点。

分类号： S827.2

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