水稻温敏型叶色突变体tsa58的变异检测及转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈能刚

作者： 陈能刚;鄢小青;李欢;杨占烈;吴荣菊;陈锋

作者机构：

关键词： 水稻;温敏型叶色突变体;变异检测;转录组分析;辐射诱变

期刊名称： 种子

ISSN：

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用60Co辐射诱变贵州地方粳稻种质资源“桥港珍珠米”,筛选获得一个温敏型叶色突变体tsa58（temperature-sensitive albino 58）,该突变体在20℃和30℃条件下培养，幼苗存在显著的叶色差异。在20℃条件下，tsa58叶片呈现完全白化；在30℃条件下，tsa58叶色与野生型无明显差异。在20℃条件下，与野生型相比，tsa58叶片的总叶绿素、叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素含量降低幅度最大，均达到极显著差异水平；在30℃条件下，与野生型相比，tsa58叶片的总叶绿素、叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素含量均与野生型无显著差异。为了明确该突变表型的候选基因，采用二代高通量测序技术对突变体tsa58和野生型进行全基因组变异分析。研究发现，在定位区间内的20878044～21473236间发生了INV（倒置）结构变异，其位点21473236位于Os02g0565400的外显子上。转录组分析结果表明，该基因在野生型中存在TSS、TTS、AE等3种剪接类型，并存在5个不同的剪接位点，而突变体tsa58未检测到可变剪接。由于该INV变异导致该基因的可变剪接类型发生变化，因此推测tsa58为Os02g0565400（WSL4）的新等位突变体。转录组差异基因分析表明，突变体tsa58与野生型的差异基因在核糖体最多，为27个，其中由叶绿体基因组编码的基因rps7、rpl32、rpl20和rps16均显著下调，而由细胞核基因组编码的基因中除OsRPL44显著下调外，其余基因均显著上调。

分类号： S511

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